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高通量测序与肿瘤课题思路演示文稿本文档共32页;当前第1页;编辑于星期六\18点53分(优选)高通量测序与肿瘤课题思路本文档共32页;当前第2页;编辑于星期六\18点53分基因突变和过高或过低基因表达是大多数慢性疾病发生的分子基础
基因突变(DNA):基因表达的改变(RNA):遗传生殖细胞突变:突变的蛋白和正常蛋白表达的改变.单个和多个基因突变体细胞突变:突变蛋白和正常蛋白表达的改变遗传单核苷酸多态性(SNP)感染生活方式环境等本文档共32页;当前第3页;编辑于星期六\18点53分分子箱(molecularbins)的概念每一个癌症都有独特的分子异常改变。根据分子异常改变制定相应的治疗方案,每个患者对治疗的疗效也会不同。如何确定molecularbins?通过基因测序可确定分子异常改变、突变、突变谱、表观遗传异常、表达谱、甲基化谱等。摘自吴一龙点评ASCO2013肺癌-分子靶向篇本文档共32页;当前第4页;编辑于星期六\18点53分流程图细胞/肿瘤黑盒个体基因的百科全书DNA测序需要特定的专业知识/技能团队才能去理解句子,段落,章节,整本基因书?PointmutationsTruncationsInsertionFusionCancerGeneticdiseases本文档共32页;当前第5页;编辑于星期六\18点53分ChenSYConfidential,保密突变X
生物/病理学的后果?
治疗靶标?多学科专家组成的医学基因信息分析团队:遗传学家,肿瘤学家,免疫学家,医生,生物信息学专家本文档共32页;当前第6页;编辑于星期六\18点53分*提纲肿瘤个体化诊疗背景测序技术的革命性发展新一代测序技术的临床应用检测流程本文档共32页;当前第7页;编辑于星期六\18点53分肿瘤个体化配药肿瘤个体化配药:对于每一肿瘤药物只有10—30%的患者能够响应治疗。但目前医生用药前无法预知哪位患者能够响应某一药物治疗。这一情况造成巨大浪费并耽误对患者治疗。2010年肿瘤药物市场600亿美元,由于事先不知患者是否对药物响应,近450亿美元的药物没有起到作用。协同开发个体肿瘤基因靶标预测及FDA药物个体化匹配,建立个体肿瘤基因表达数据库找到药物敏感的标签基因至关重要。目前:FDA批130多种肿瘤药物对应80多种基因靶标,有的基因靶标并无对应的药物,利用基因靶标的标签基因表达谱扫描FDA非肿瘤药物作用于肿瘤细胞的基因表达关联谱数据库来寻找匹配药物—“药物新用”给FDA非肿瘤药物找到抗癌用途。已有成功报道。本文档共32页;当前第8页;编辑于星期六\18点53分肿瘤诊疗的进展和未来的趋势从单个基因检测到多基因检测,确立肿瘤基因型,减少对病种(组织学层次)的依赖按照突变基因组合(pattern)对肿瘤分型,选择适用靶向药物/药物组合。检测原癌基因、抑癌基因、DNA错配修复基因的基因型为目前的基因检测组合。未来:更多的基因突变+基因mRNA表达水平+甲基化+microRNA水平+蛋白水平+…的综合分型?off-label用药从单基因突变型/野生型到按突变pattern用药:突变在没有FDA批下来的适用症中出现,药物有效,称为off-label用药,如贝伐单抗。单一用药到复合用药:肿瘤治疗的组合用药多基因检测,综合性分析本文档共32页;当前第9页;编辑于星期六\18点53分*癌症的发生是个漫长的过程,潜伏期长达5-20年癌细胞数量1031061091010-111012本文档共32页;当前第10页;编辑于星期六\18点53分*形态学免疫分型免疫球蛋白电泳免疫组化基因定性、定量基因突变检测MSIWHO规范化肿瘤综合检测-MICM分类标准免疫学细胞遗传学分子生物学常规病理血细胞涂片核型分析荧光原位杂交MICM癌症诊断的分子化侵袭性生长与转移宏观恶性增殖与无控生长细胞遗传学表型的改变分子本文档共32页;当前第11页;编辑于星期六\18点53分*21世纪肿瘤治疗的策略的转变转化医学(分子诊断技术)?2004年ASCO会议预测:5-10年后进入“个体化疗”时代?2009年ASCO会议倡
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