2024病原宏基因组高通量测序临床本地化检测规范专家共识（完整版） .pdfVIP

2024病原宏基因狙高通量源序临床本地化检测规范专家坏讯（完整版）

摘要

感染牲疾品严逾危害人类生命健康，快速准碗检测偶原体是有效治疗和祐

准防控感染性疾病的关谜环节C传统的病原学检脸技术甩就的微生物关

少，姬以凋足临床需求。宏基因组高通址测序（eNGS）理论上可同时检

澳I所有巳知瓜因序列的病原体.在很大程度上提高了临床疑雄危敢娼染、

早见和新发病原体感染的诊断水平和救治能力。在个体化横狞需求的大背

景卜《新技术的实牧室，建检测能够持续提高临床诊治水平.由JmNGS

技术平台研发起点高、操作流程夏柴，为了保证该技术合理应用，保障患

有医疗安全，本文在临床检验、感染、危咆症及体外诊断等知域的专家轼

mNGS-LDT的流程搭建、性能确认、质峨控制、报告审核等方面形成火

识井提出规范要求和建议。

实验室自建检测（laboratorydevelopedtest,LDT）是指实臆室自行研

发、确认，仅限于本实验室使用的检测技术［I］。近年来，随看检

测技术的创新和发展，一些前沿技术如族因测序、质谄分析和流式绷胞术

等快速从基础研究向临床转化，并展现出住好的应用前景、美国巳将体外

诊断＜invitrodiagnostics,IVD）新技术纳入LDT模式管理［2］。

我国2016年《国家□生计生委办公厅关于临床检拘康口管理有关问腕的

通知》提出，对F未列入《医疗机构临床检技项日目录》，但临床意义明

确、蓉什性和敏感性较好、价格效益合理的临床检约璃,隘当及时i仑证，

满足临床而求［3］。2021年国京药品监皆代理同发布的《医疗器械

眩智管理条例》中指出，甘国内尚无同M砰产MI:市的体外诊断试币I,符

合条件的庚疗机构根据末单位的临床能要，可以fl行研制，在执业庆师指

导下在本挚位内使用［4］。宏雄因蛆高通M测J*技(metagcnomic

nextgenerationsequencing,mNGS)可以不基于假设、无偏简地检

测疑似感染患者标本中的病原微生物，扩大病原体检浏类，缩短检测时

问提供可用丁患#诊断、制定治疗方案的关键信息，有效提升感染性疾

病的诊疗水平，助力抗菌苛物合理应用［5］・mNGS还有助卜解决

新发、芋也、疑难耕原体的潮检问题［6,7,8,9)。但mNGS相

•S病原体神类多、临床盼让唯度大、睑证周期长，便得常规IVD产命注册

较为困难。为满足怖床沛要，本共识将在实验室符合国家相关政策法规以

及保证检测方法忤.能可辎的前提下如何在本地开展mNGS检测提出具体

指导意见。

一、niNGS实捡室建设基本要求

(-)突险室结构布局和环境条件

mNGS在实!捡环坦中根据是否使用聚合醒链式反祖(polymerasechain

reaction,PCR)构建文库，凹分为PCR建库号PCRJree建库的大类型，

俯者在实知室空间龄求匕有所差弁PCR建炸中采用通用引物对文摩核酸

分子进行扩增，核酸产物浓度较高，对产物的后续操作(加热、震子、离

心、混匀、移液）叫能产生，溶胶，易造成实盼室耳境和用他文麻的iVJft,

从而产生偶阳性结果:因此，基FPCR建库的mNGS实验室宜参照《医

疗机构临床基因扩增管理办法》［10］WlXztj求，在符合PCR要求

的实般室中开展，防止棱酸扩增产物造成的实阪室污染。

幕于PCR-free建库的mNGS实验可在同•个空问内设世试削淮备区、标

本处理区（配备生物安全柜）和建库测序区（PCR-lree建库、文库纯化、

等届混合、上机测J*）.PCR-frcc文片浓度可能低于Qubit荧光定哒仪的

检测限，任议使用荧光定量PCR（quantitativepolymerasechain

reaction,qPCR）方法进行文库浓度测定。鼠然莅J：PCR-free建昨的

mNGS实检在文庠定歧前实验操作不存在PCR扩增建岸所帝来的溶胶

风险，（H仍然需要警悔人员操作等带来的气溶胶污染可能性，并在一个相

对独#的空间进行qPCR法文库浓度测定.

（二）生物安全防护

mNGS所检测的微生物涉及范悯广泛，实险操作糊该在具备至少生物安全

二级（biosafetylevel2,BSL-2）资质的实验室中进行,并按照生物安

全相关要求进行操作。如果处理疑高致弼性病原体的标本，须满足史高

耍求的行业标准和规范的要求［11］。

（三）设备设施

mNGS实检设备和器材应能滴足湿实的、「•实盼和康M控削溢求