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epc10膜⽚钳patchmaster数据处理分析2
EPC10膜⽚钳PatchMaster数据处理分析PatchMaster⽣成以.dat为后缀格式的数据,⽤相应的记录软件PatchMaster可以直接打开,尽管在PatchMaster提供的OnlineAnalysis功能可
以对感兴趣的参数数据进⾏获取并输出,但是对某些数据的分析还需借助第三⽅软件处理后再进⼀步的分析;在此结合实际使⽤,总结⼀下对突触后电流发放及多个动作电位如何更
好的分析,这两种数据的特点是需要对多个电流或电位的峰值、阈值、时程等多个参数进⾏获取,⽬前国内处理这类数据主要使⽤MiniAnalysis软件,因此如何运⽤MiniAnalysis转换
并处理以上两种数据进⾏总结,供⼤家参考。
1.数据初步输出
1.1在PatchMasterReplay窗⼝打开数据时,可以看到数据是以树型结构排列的,如果这⼀个⽂件下数据太多,但是需要分析的数据往往只要某⼀个,所以先选定要分析的数据,在
Oscilloscope看到要分析的数据
1.2将需要分析的数据以Pulse格式输出,在Replay菜单下选定输出格式为PULSEv8.6,之后Export该数据,
选好路径,保存该数据就可以了,这样主要是为了使要分析的数据成为单独的⼀个data,便于后续的转换和分析。
2.数据转换
在安装了MiniAnalysis软件后会有⼀个附加的功能ABF
Utility,准备利⽤它进⾏数据转换,打开后找到刚才保存下的数据,选中.dat格式的⽂件,然后点击右侧ConvertKnownFiletoABF,
此时会提⽰未知格式是否转换,选Yes,出来个对话窗⼝,此窗⼝参数填写⼀定要正确,在SamplingInterval填写与Patchmaster采集该数据时⼀致的采样率,这样确保转换出来的数
据X轴正确,下⾯Unit单位选择pA或mV与你采集的数据⼀致,ScalingFactor确保Y轴⼀致,原始数据Y值如果是电流值的话,在Gain是1情况下采集的信号,写0.001,Gain2写
0.002,电压值的话0.01,以此类推,实际中多试⼏次确保转换后的Y值与原始值想匹配,在上述值都正确的情况下点击ConverttoABF,这样在主窗⼝的右侧出现转换后的数据,
⾄此,数据转换结束。
3.数据分析
通过上述⽅法转换后的数据可以直接⽤clampfit或minianalysis打开了,根据需要可以选择适合的软件分析数据。在此,主要说⼀下MiniAnalysis的使⽤。
打开MiniAnalysis主程序,通过右侧Flies打开转换后的⽂件⼀定要是.ABF格式的,通过调整左侧上⽅控件Gain及左侧游标位置,及左下⽅x轴⼤⼩将电流图调整合适。
此时选择右上⽅Analysis,出现⼀些分析需要设定的选项,根据数据设置合理的选项进⾏⾃动分析,下⾯的Analysisthiswindow点击会根据设定的相应值对事件⾃动分析在下⽅就看
到每个events的各个参数,可以根据初步得到的参数对以前设定的值进⾏调整,将所要研究的Events都包括进去,也可以⽤⿏标直接点击电流图中的各个Events得到相应的参数,这
样接着在Analysisnextwindow或nonstopanalysis对所有数据⾃动分析完毕。
各个Event参数可以选定复制到Excel、Origin、SigmaPlot等数据分析绘图软件⾥进⾏进⼀步的分析绘图。
该数据处理完毕后就形成⼀个处理后的数据,此时不能直接关闭MiniAnalysis软件,否则此处理结果不会保存,可以选择另⼀个需要分析的数据,选Yes,这样就会出现⼀个.EVT
格式⽂件,这样以后就可以直接⽤MiniAnalysis打开分析过的数据。
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