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·818·检验医学2023年9月第38卷第9期LaboratoryMedicine,September2023,Vol.38,No.9
文章编号:1673-8640(2023)09-0818-07中图分类号:R446.1文献标志码:ADOI:10.3969/j.issn.1673-8640.2023.09.003
前列腺癌进展相关转录因子研究
孙传玉1赵晓君2葛圣阳1张扬3
(1.复旦大学附属华山医院,上海200040;2.上海市临床检验中心,上海200126;
3.复旦大学生物医学研究院,上海200032)
摘要:目的对相关研究发现的46个前列腺癌差异表达蛋白的上游转录调控机制进行分析和探讨。方法采用GeneGoMetaCore软件和IPA软件对46个差异蛋白进行生物信息学分析,明确这些差异蛋白的转录因子调控网络。采用GEPIA2数据库分析鉴定出的转录因子的表达量及其对前列腺癌患者生存情况的影响。结果 共鉴定出20个转录调控网络。按差异表达蛋白的富集度进行排序,筛选出居前6位的转录调控网络,分别由特化蛋白1(SP1)、p53、阴阳1(YY1)、雄激素受体(AR)、c-Myc和Slug6个转录因子调控。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,高表达p53的前列腺癌患者无病生存期和总生存期均长于低表达p53的患者(r值分别为0.047、0.019),低表达AR的前列腺癌患者无病生存期长于高表达AR的患者(r=0.023),其余4个转录因子对前列腺癌患者预后无影响(r0.05)。IPA软件分析结果显示,SP1、p53、YY1、AR和c-Myc由表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、蛋白激酶B(AKT)1、成纤维细胞生长因子2(FGF2)、β-雌二醇调控。结论通过分析46个前列腺癌差异表达蛋白的转录调控网络,发现6个与前列腺癌相关的转录因子和4个上游调节分子,可为前列腺癌早期筛查和预后评估提供新的靶标。
关键词:蛋白质组学;转录因子;转录调控;前列腺癌
TranscriptionfactorsinprostatecancerprogressionSUNChuanyu1,ZHAOXiaojun2,GEShengyang1,ZHANGYang3.(1.HuashanHospital,FudanUniversity,Shanghai200040,China;2.ShanghaiCenterforClinicalLaboratory,Shanghai200126,China;3.InstitutesofBiomedicalSciences,FudanUniversity,Shanghai200032,China)
Abstract:ObjectiveToinvestigatethe46differentiallyexpressedproteinsofupstreamtranscriptionalregulationmechanisminprostatecancer.MethodsGeneGoMetaCoresoftwareandIPAsoftwarewereusedtoconductbioinformaticsanalysisondifferentialproteinsandclarifythetranscriptionalregulatorynetworkofthesedifferentialproteins.GEPIA2databasewasusedtoanalyzetheexpressionlevelofidenti?edtranscriptionfactorsandtheirimpactsonthesurvivalofprostatecancerpatients.ResultsTotally,20transcriptionalregulatorynetworkswereidenti?ed.Accordingtotheenrichmentofdifferentiallyexpressedproteins,thetop6networksweres
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