分子生物学分子生物学 (57).pdf

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/scientificreports

OPENCompletemitochondrial

genomeofthemedicinalfungus

Ophiocordycepssinensis

received:08March2015

1,21,31,341,35

Accepted:07August2015YiLi,Xiao-DiHu,Rui-HengYang,TomHsiang,KeWang,De-QuanLiang,

55551

Published:15September2015FanLiang,De-MingCao,FanZhou,GeWenYi-JianYao

AspartofagenomesequencingprojectforOphiocordycepssinensis,strain1229,acomplete

mitochondrial(mt)genomewasassembledasasinglecirculardsDNAof157,510bp,oneofthe

largestreportedforfungi.ConservedgenesincludingthelargeandsmallrRNAsubunits,27tRNA

and15protein-codinggenes,wereidentified.Inaddition,58non-conservedopenreadingframes

(ncORFs)intheintergenicandintronicregionswerealsoidentified.Transcriptionanalysesusing

RNA-SeqvalidatedtheexpressionofmostconservedgenesandncORFs.Fifty-twointrons(groupsI

andII)werefoundwithinconservedgenes,accountingfor68.5%ofthegenome.Thirty-twohoming

endonucleases(HEs)withmotifpatternsLAGLIDADG(21)andGIY-YIG(11)wereidentifiedingroup

Iintrons.ThencORFsfoundingroupIIintronsmostlyencodedr

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