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实验6-4二氟二氯甲烷分子轨道的从头算法
操作流程
用Chem3D建立分子构型
打开Chem3D程序,新建一个文件,在空白处键入分子式,回车后能看到出现了分子的初始构型。在View菜单下的setting中可以设置分子结构的显示方式,一般用BallStick。在Tools菜单下的showmodeltable下可以选择显示分子中各原子的初始坐标。将此坐标记录下来。
对分子构型做能量的初步优化
在Mechanics菜单下选择MinimizeEnergy,参数设置见下方Summary。参数设置好以后点选Run,则进行分子构型的能量的初步优化。该过程至少重复2次。构型优化结束后,记录分子中各原子坐标。
3.对分子构型做进一步优化
选择Gaussian菜单下的CreateInputFile,各参数设置如下方Summary所示。设置好以后点击Create生成.gjf文件(可取名为input.gjf),这是Gaussian09程序的输入文件。
打开Gaussian09程序,从file菜单下打开刚保存的.gjf文件,检查一下是否有问题。没有问题了就可以run了。计算结果为input.out文件。
打开input.out文件可以看到优化结果,找到最后一组坐标,这是最终优化结果,将此坐标记录。然后将此坐标填写到input.gjf中(替换原来的坐标),修改方法和基组为HF/6-311++G(d,p)进行第二次优化,优化结束后在输出文件中找到最后一组坐标,得到最终优化结果。在实验报告中对比所有记录的坐标,比较分析计算结果。
4.计算分子轨道波函数和电离能
按input.gjf格式建一个文档(可以直接用Gaussian09程序打开input.gjf进行修改)。如利用HF方法6-31G基组做它的位置空间波函数,则各命令行如下:
%Chk=HF631G.chk(生成.chk文件,用来计算电子密度分布)
#HF/6-31G6D10FSCF=TIGHTPOP=FULLGFINPUT
(计算分子轨道波函数和轨道电离能的命令行)
CF2Cl2(分子名称)
01(电荷和自旋)
C0.0000000.0000000.000000
F0.0000001.0807940.788312
F0.000000-1.0807940.788312
Cl1.4758330.000000-0.993804(原子坐标)
Cl-1.4758330.000000-0.993804
其他方法基组类似。输入文件改好以后就可以直接利用Gaussian09运行了,计算结束后给出一个相应的输出文件(可命名为hf631g.out),在最后一组结构下面给出了HF/6-31G方法的基组,如下:
S61.00
0.3047524880D+040.1834737130D-02
0.4573695180D+030.1403732280D-01
0.1039486850D+030.6884262220D-01
0.2921015530D+020.2321844430D+00
0.9286662960D+010.4679413480D+00
0.3163926960D+010.3623119850D+00
SP31.00
0.7868272350D+01-0.1193324200D+000.6899906660D-01
0.1881288540D+01-0.1608541520D+000.3164239610D+00
0.5442492580D+000.1143456440D+010.7443082910D+00
SP11.00
0.1687144782D+000.1000000000D+010.1000000000D+01
****
......
紧接其后给出了CF2Cl2分子占据和非占据轨道及其能量特征值(电离能),如下:
OrbitalSymmetries:
Occupied(B1)(A1)(B2)(A1)(A1)(B1)(A1)(A1)(B1)(A2)
(B1)(B2)(A1)(A1)(B2)(A1)(B1)(A1)(B2)(B1)
(A1)
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