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基于核磁共振技术
的代谢组学研究进展1
生命科学领域的核磁共振技术代谢组学概述基于核磁共振的代谢组学研究进展2
一、生命科学领域的核磁共振3
磁共振成像(NMRI,NuclearMagneticResonanceImaging)磁共振定域谱(MRS,MagneticResonanceSpectroscopy)核磁共振波谱(NMR,NuclearMagneticResonanceSpectroscopy)核磁共振4
二、代谢组学概述5
JeremyKNicholsonImperialCollegeLondon,UK代谢组学的定义Metabonomics:thequantitativemeasurementofthemulti-parametricmetabolicresponseoflivingsystemstopathophysiologicalstimuliorgeneticmodifications对生物系统因病理生理或基因改变等刺激所致动态多参数代谢应答的定量测定。J.K.Nicholson,J.C.Lindon,E.Holmes.Xenobiotica,1999,29:1181-89.技术:NMR动物代谢分析:动物的体液和组织6
OliverFiehnUniversityofCaliforniaHealthSciencesDriveDavis,USAMetabolomics:comprehensiveanalysisofallthemetabolitesofanorganism.Thequantitativemeasurementofalllowmolecularweightmetabolitesinanorganism’scellsataspecifictimeunderspecificenvironmentalconditions.生物体所有代谢物的系统分析。本质是“给定细胞在给定时间和条件下所有小分子代谢物的定量分析”。O.Fiehn.PlantMol.Biol.,2002,48:155–171.技术:GC-MS植物代谢分析:细胞7
代谢组学的发展198219831984198919992000200120022004Sadler,BuckinghamandNicholson:Firstpublicationon1H-NMRofbloodandplasmaNicholson,etal.:Multi-componentanalysisofspectradatafromraturineNicholsonandWilson:NMRspectroscopyofbiofluidsNicholson:DefinitionofMetabonomicsHaselden,etal.:FirstindependentPharmapublicationofMetabonomicsNicholson,Lindon,andHolmes:PublicationinNatureonMetabonomicsHolmesandAntti:ExplanationofstatisticsinMetabonomicsIncreasing#ofpublicationsVanDeGreef:publicationofMSforurineprofilinliver:DefinitionofMetabolomeHorming,etal.:Metabolicprofilesofmetabolitesinhuman8
代谢组学的中心任务对生物体液和组织中内源性代谢物质进行系统测量和分析。对生物体在受到病理生理上的刺激以及某种基因修饰所带来的代谢物的动态变化进行量化和编录,从而得到生物体代谢随时间及生化过程的变化而改变的信息。将这些信息与病生理过程中的生物学事件关联起来,从而确定此变化规律相关的靶器官和作用部位,进而确定相关的生物标志物。9
系统生物学(SystemsBiology)的组成表现型(phenotype)个体(individual)器官(organ)组织(tissue)细胞(cell)代谢物(metabolite)蛋白质(protein)mRNADNA代谢组(metabonome/metabolome)蛋白质组(proteome)转录组(transcriptome)基因组(genome)代谢组学(metabon
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