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中国组织工程研究大数据分析

www.CJTER.comChineseJournalofTissueEngineeringResearch

加权共表达网络分析与机器学习识别类风湿关节炎滑膜中的关键基因

1211

武英楷,,史高龙,谢宗刚

/10.12307/2025.244

文章快速阅读:类风湿关节炎滑膜中关键基因的加权共表达网络分析与机器学习识别

投稿日期:2023-12-27

GSE77298GSE55235

采用日期:2024-02-26

修回日期:2024-03-13数据集合并、标准化

在线日期:2024-03-29

差异基因分析加权共表达网络分析免疫浸润分析

中图分类号:

R459.9;R318;R684基因本体论、KEGG、疾病本体论富集分析交集基因

文章编号:

LASSOSVM-RFERandomForest

2095-4344(2025)02-00294-08

文献标识码:A

GSE55457验证关键基因免疫相关性

构建列线图、DCA分析受试者工作特征分析

文题释义:

加权共表达网络分析:可以用来鉴定高度协同变化的基因集,并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或

治疗靶点,在筛选疾病特征生物标志物和潜在防治靶点中表现出明显优势。

()

机器学习:能够构建一种特殊算法而非某一个特定的算法,可以让计算机自己在数据中学习从而进行预测,在疾病生物标志物、发病机

制、治疗靶点等方面的研究中得到了广泛的应用。

摘要

背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫

切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物。

目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并筛选类风湿关节炎患者滑膜中的关键基因,构建类风湿关节炎预测模型并进行

验证。

3(GSE77298GSE55235GSE55457)GSE77298GSE55235

方法:从基因表达综合数据库中下载个包含类风湿关节炎患者滑膜的数据集、、,和作

GSE55457663927R

为训练集,作为测试集,共纳入个样本,其中类风湿关节炎患者滑膜样本个,正常滑膜样本个。应用语言筛选训练集中

的差异基因,然后使用加权共表达网络将训练集中的基因模块化,选出关键模块中的特征基因,将差异表达基因和特征基因取

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