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实验四RNA的提取及其纯度检测
实验目的:了解Trizol提取总RNA的原理,掌握高质量完整总RNA提取的技术以及
电泳变性胶电泳检测和浓度及纯度鉴定方法。
实验原理
Trizol是一种酚与异硫氰胍的混合物,非常容易把组织和细胞中的总RNA提取出来。
在加入氯仿离心后,RNA保留在水相中,与DNA和蛋白质分离开来(保留在有机相中)。
吸取水相,加入异丙醇成淀RNA,从而得到完整纯度高的总RNA。
实验内容
材料小鼠新鲜肝
试剂
总RNA提取纯化试剂:Trizol(Invitrogen);DEPC(Amersham),无水乙醇,已丙醇;
电泳试剂:TAE,上样缓冲液(50%甘油,10mMEDTA,0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青),
琼脂糖。
操作步骤
总RNA的提取
1小鼠肝组织的匀浆裂解
断颈处死小鼠,立即解剖取出肝脏,取50-100mg到玻璃匀浆器中,假如1mlTrizol反
复匀浆膜碎组织,使细胞完全裂解。按1mlTrizol加入0.2ml氯仿,震荡15秒,室温放置
3分钟,12000×g,4℃离心15分钟。
2RNA的沉淀
将离心的上清转移到新的离心管中,按1mlTrizol加入0.5ml异丙醇,震荡15秒,室
温放置10分钟,12000×g,4℃离心10分钟。
3RNA的洗涤与溶解
吸掉上清,加入1ml75%乙醇洗涤沉淀,4℃,7500×g离心5分钟。吸掉上清,空气
干燥RNA沉淀10分钟,加入适量的DEPC处理水(50μl)溶解RNA,立即电泳和紫外浓
度和纯度鉴定,剩余-70℃保存备用。
结果
在凝胶上可以看到一般可以看到三条带,其中从上样孔开始对应的带的分别是28S,18S
和5S,其中18S和28S的条带明显清晰,而5S的带比较弱,28S的带的亮度是18S带亮
度的2背左右,说明RNA保持完整。
紫外分光光度法测定RNA的浓度和纯度
总RNA用10mM的Tris-HCl(pH8.0)稀释,利用紫外分光光度计测定A和A值,根
260280
据1OD=40ug定量,并计算A/A比值,每一样品重复3次。
260280
如果A/A比值均在2.0以上(2.0-2.2之间),说明RNA的纯度很好。
260280
注意事项
创造无Rnase的环境
注意以下几点,以防止Rnase污染样品,保证分离到全长mRNA:
1、手和空气中的细菌霉菌是主要的Rnase污染源。为防止污染,应在超净台上无菌操作。
这些试剂都要反复使用,所以开启和关闭试剂瓶一定防止污染。一直带塑料手套。
2、最好用一次性使用塑料制品提RNA,这些制品常是无RNase的,无须灭活RNase。
3、不是一次性使用的玻璃和塑料制品,用前应除RNase。玻璃制品应于200℃烘烤过夜,
塑料制品用前用0.1NNaOH,1mMEDTA作彻底冲洗,再用无RNase水冲洗。
4、用户自备的溶液应用0.05%DEPC处理过夜,再高压灭菌30分钟以出去痕量DEPC。
实验五逆转录PCR(RT-PCR)扩增基因特异片段
实验目的了解RT-PCR的原理,掌握RT-PCR扩增基因的特异片段的技术。
实验原理
PCR(PolymeraseChainReaction;聚合酶链式反应)是一种体外扩增DNA的简单而有
效的方法。虽然原理上PCR法是扩增DNA,RNA不能直接被扩增,但是经过反转录酶的
作用把RNA反转录成cDNA后,PCR法便可应用于RNA的解析了。迄今为止,此方法已
广泛应用于RNA的构造解析、cDNA的克隆及RNA水平上的表达解析等多种领域。
编码蛋白质的基因在转录后形成mRNA,mRNA
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