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环境DNA技术
先看一道试题:
环境DNA(eDNA)技术是指从环境中提取DNA片段,结合PCR和DNA
测序等分子生物学技术来定性或定量检测目标生物,从而确定其分布
状况等,是一种新型生物资源调查手段。科研人员利用eDNA技术对
某段长江流域的江豚分布进行了调查。
(1)江豚是我国现存的唯一水生哺乳动物,国家一级濒危物种,不
宜用传统的法进行种群数量调查。江豚在生态系统中属
于。
(2)水样中提取的eDNA来源很丰富,可能来自水中动植物死亡后的
组织细胞及各种排泄物,以及水中的,甚至可能来自陆生动
植物遗留在水中或由于人类活动进入到水体中的DNA。
(3)设置10个检测点,采集水样并提取。检测点包括观
测到江豚出现的水域,以及未观测到但适宜江豚生存的水域(疑似
点)。
(4)eDNA分析首先根据江豚线粒体的特有基因设计,然后
进行荧光定量PCR。每一个循环包括、复性和延伸三步,需
要的酶是。每个DNA样品重复测定3次。结果如下表所示:
注:“-”表示未检出。
测定结果显示,观测到江豚的4个水域结果都呈阳性,其他6个疑似
点中的检测结果也呈阳性,说明这些疑似点也是江豚活动的
水域。
(5)eDNA技术具有高灵敏、低成本、无损伤、快捷方便等优点,应
用前景广泛,但不能用于。
A.物种多样性的研究B.某种鱼类的食性分析
C.濒危物种的调查D.准确判断物种的实时存在情况
(6)目前鱼类资源的减少被认为是造成长江江豚数量下降的主要原
因之一。研究者用eDNA技术测定了该流域内浮游动物的生物量,可
进一步根据营养级之间的估算出鱼类资源量,进而评价该流
域江豚的生存状况。
答案:(1)标志重捕消费者(2)微生物(3)eDNA(4)
特异性引物变性(解链)耐热的DNA聚合酶(Taq聚合酶或热
稳定DNA聚合酶)S2、S3(5)D(6)能量传递效率
解析:eDNA是指环境中的DNA分子,生物多样性中有基因多样
性,所以可以根据基因的特异性进行检测生物的种类及判断生物的数
量。
(1)对动物种群密度的调查方法通常是标志重捕法,由于江豚数量
少,所以不宜用该方法,江豚在生态系统中属于消费者。
(2)水样中提取的eDNA是水中能够提取到的所有的DNA,所以还包
括水中微生物的DNA。
(3)首先提取eDNA。
(4)对提取的DNA需要进行PCR扩增,需要设计特有的引物,PCR
的步骤是变性(解旋)、复性和延伸,整个过程是在高温下进行的
DNA复制过程,所以需要耐高温的DNA聚合酶。
测定结果显示,在S4、S7、S8、S9这几个区域能够观察到江豚,
水域结果呈阳性,而在S2和S3也有DNA分子检测到,说明些疑似点
也是江豚活动的水域。
(5)eDNA技术是大规模提取生物及残留的DNA分子进行检测,所以
可以通过对DNA的检测分析物种多样性,通过对鱼类消化道残留食物
的DNA的检测鱼类的食性,分析濒危物种,但不能准确判断物种的实
时存在情况。故选D。
(6)由于江豚以浮游动物为食,所以根据浮游动物的生物量和营养
级之间的传递效率推测鱼类资源情况。
这道试题提到了“环境DNA”技术。
那么,什么是环境DNA(eDNA)技术?有什么应用?
如何尽可能减少对野生动物生活的干扰,同时密切关注它们种群
的变化。环境DNA(eDNA)分析的发展,有望解决这一难题。环境DNA
分析,是一种不对目标物种造成危害的生物种群监测工具。对于加深
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