砂藓生长素受体基因RcTIR1的克隆及表达分析_张春蕾.pdf

基因组学与应用生物学，2015年，第34卷，第1期，第100-105页

GenomicsandAppliedBiology,2015,Vol.34,No.1,100-105

研究报告

ResearchReport

砂藓生长素受体基因RcTIR1的克隆及表达分析

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张春蕾沙伟张梅娟索荔周伯

齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,齐齐哈尔,161006

*通讯作者,shw1129@263.net

摘要本研究我们试图利用PCR技术从砂藓中克隆TIR1基因的cDNA全长序列，对其进行了生物信息学

分析，采用实时荧光定量PCR分析该基因在复水和干旱过程的表达情况。我们将砂藓转录组测序获得的生长

素受体蛋白基因序列命名为RcTIR1，基因cDNA全长为1110bp，开放阅读框(ORF)长度为615bp，共编码

204个氨基酸。生物信息学分析显示，该基因所编码蛋白理论等电点为5.70，不稳定指数为32.85，总平均

亲水性为-0.027，无跨膜区和信号肽，亚细胞定位在细胞核。利用实时荧光定量PCR方法检测对该基因在

砂藓复水和快速干旱过程中的表达模式显示在砂藓的复水过程和干旱处理中该基因均有差异性表达。通

过研究砂藓生长素受体蛋白基因RcTIR1与砂藓干旱胁迫的关系，为植物逆境胁迫机制的研究以及该基因

的实际应用奠定基础。

关键词砂藓,RcTIR1,基因克隆,表达分析

CloningandExpressionAnalysisofAuxinReceptorGeneRcTIR1in

Racomitriumcanescens

*

ZhangChunleiShaWeiZhangMeijuanSuoLiZhouBo

CollegeofLifeScienceandAgricultureandForestry,QiqiharUniversity,Qiqihar,161006

*Correspondingauthor,shw1129@263.net

DOI:10.13417/j.gab.034.000100

AbstractInthisresearchwetriedtocloneafulllengthcDNAsequenceofTIR1genefromRacomitrium

canescensbyusingPCRtechnologyaswellastodotheanalysisofbioinformatics,whildbyusingquantitative

real-timePCRtoanalyzeexpressionprofilesofthegeneintheprocessofhydrationandrehydrationoneofthe

genesshownhighsimilaritywithtransportinhibitorresponseprotein1genehaswasWenamedthegeneas

RcTIR1,thatwasobtainedfrombysequencingtranscriptomeofRacomitriumcanescens,thefulllengthcDNA

sequenceofRcTIR1was1110bpinlength,withopenreadingframeof615bpthatencodesaproteinof204

aminoacidresidues.BioinformaticsanalysisindicatedthatRcTIR1genehasatheoreticalpI5.70instabilityindex

32.85,andthetotalaveragehydrophilicity-0.027.Theproteinlocatedinthenucleuswithoutsignalpeptidesand

transmembraneregion.Thereal-timePCRanalysisshowedthattheexpressionprofilesofRcTIR1genewas

differencethatchangesinrehydrationprocessanddehydrationtreatment.Thoughthestudiesontherelationship

betweenauxinreceptorgeneRcTIR1anddroughtstressofRacomitriumcane