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基因组学与应用生物学,2015年,第34卷,第4期,第792-796页
GenomicsandAppliedBiology,2015,Vol.34,No.4,792-796
研究报告
ResearchReport
砂藓MYB转录因子基因RcMYB的克隆及表达分析
*
沙伟索荔张梅娟张春蕾周伯
齐齐哈尔大学,生命科学与农林学院,齐齐哈尔,161006
*通讯作者,shw1129@263.net
摘要以砂藓(Racomitriumcanescens)转录组测序获得的一条与抗旱相关的MYB转录因子基因为基础,
采用RT-PCR技术克隆得到该基因的cDNA全长序列,命名为RcMYB。该序列全长为862bp,开放阅读框
为726bp,共编码氨基酸241个。该基因的蛋白相对分子质量为28.8kD,等电点为7.77,不稳定系数为
70.03,是不稳定性蛋白,平均亲水数为-0.548,预测分析该蛋白具有强亲水性。蛋白结构域分析表明,
RcMYB蛋白含有Myb-DNA结合结构域和MYB-CC结构域。实时荧光定量PCR研究表明,在复水过程和
干旱处理的条件下RcMYB基因均有所表达。上述研究结果为基因RcMYB的功能研究奠定基础。
关键词砂藓,MYB转录因子,RcMYB基因,基因克隆,表达分析
CloningandExpressionAnalysisofMYBTranscriptionFactorGene
RcMYBfromRacomitriumcanescens
*
ShaWeiSuoLiZhangMeiJuanZhangChunleiZhouBo
CollegeofLifeScienceandAgricultureandForestry,QiqiharUniversity,Qiqihar,161006
*Correspondingauthor,shw1129@263.net
DOI:10.13417/j.gab.034.000792
AbstractAfulllengthcDNAsequenceofMYBtranscriptionfactorgenewasclonedfromRacomitrium
canescensusingRT-PCR,namedasRcMYBRcMYB.was862bpinlength,andopenreadingframeof726bp,
encodingaproteinof241aminoacids.Proteinrelativemolecularmassofgenewas28.8kDandpIwas7.77.
Unstablecoefficientis70.03andshowedthisproteinwasinstabile,andaveragenumberofhydrophilicwas
-0.548.Predictionandanalysisofsequenceshowedtheproteinwashighlyhydrophilic.Proteindomainanalysis
showedthatRcMYBproteincontainedMYBDNA-bindingdomainandMYB-CCdomain.TheqRT-PCRresults
showedthatRcMYBgenecouldexpressinwaterrecoveryprocessanddroughttreatment.Theresultswouldlay
thefoundationsforthestudyofRcMYBgenefunction.
KeywordsRacomitriumcanescens,MYBtranscriptionfactor,RcMYBgene,Genecloning,Expressionanalysis
植物受到非生物胁迫后,会通过体内的生理生有识别功能并结合DNA的大沟(Ogataetal.,1996;Jia
化和分子机制进行调节,快速修复逆境胁迫所造成etal.,2004)。所以根据MYB转录因子结构域和序列数
的损伤,适应不断变化的环境。而转录因子在介导适目不同分为4种类型:(1)1R-MYB;(2)R2R3-MYB;
应环境的变化过程中发挥重要作用。(3)3R-MYB;(4)4R-MYB,R1/R2。共4个结构域组
MYB转录因子是植物转录因子中最大的家族成(Dubosetal.
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