科研技能教程单元课06TCGA肿瘤数据库使用教程(一).pptxVIP

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DatatypessupportedbyRTCGAToolbox.DataType(Parameter)DescriptionOutputObject(FirehoseData)ClinicalProvidesclinicalinformationforeachsample.Clinicalinformationmayincludestage,survivaltime,sex,ageandmore.fd@Clinical(dataframe)RNAseqGeneor/andRNAseq2GeneNormGenelevelexpressiondatafromRNA-seqplatforms.Thisparameterprovidesrawcountsandnormalizedvalues.Firehoseprovides2differentalgorithmsforRNAseqdataprocessing.(DatatypescanbespecifiedbyusingRNAseqNormandRNAseq2Normparameters)fd@RNASeqGene,fd@RNASeq2GeneNorm(datamatrix)miRNASeqGenemiRNAexpressionlevelsfromnextge

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