生物信息学绪论.pptVIP

10蛋白质组研究*基因组对生命体的整体控制必须通过它所表达的全部蛋白质来执行，由于基因芯片技术只能反映从基因组到RNA的转录水平上的表达情况，由于从RNA到蛋白质还有许多中间环节的影响，因此仅凭基因芯片技术我们还不能最终掌握生物功能具体执行者——蛋白质的整体表达状况；近几年在发展基因芯片的同时，人们也发展了一套研究基因组所有蛋白质产物表达情况——蛋白质组研究技术，从技术上来讲包括二维凝胶电泳技术和质谱测序技术。通过二维凝胶电泳技术可以获得某一时间截面上蛋白质组的表达情况，通过质谱测序技术就可以得到所有这些蛋白质的序列组成。这些都是技术实现问题，最重要的就是如何运用生物信息学理论方法去分析所得到的巨量数据，从中还原出生命运转和调控的整体系统的分子机制。蛋白质组研究*11药物设计：*诊断类药物：生物芯片设计遗传病：基因诊断感染性疾病：抗体、基因芯片、PCR技术*病人／健康人基因芯片诊断及早治疗，对症下药预防类药物：计算机辅助疫苗设计计算机预测抗原表位3）、开发基因组药物*所谓基因组药物(Genomicdrug)是指利用基因序列数据，经生物信息学分析、高通量基因表达、高通量功能筛选和体内外药效研究开发得到的新药候选物．实际上利用了反向生物学的原理．沿着从基因序列一蛋白质一功能一药物的途径研制新药，其优势是取自庞大的人类基因资源及其编码蛋白质做为原材料，具有巨大的开发潜力。美国的人类基因组科学公司(HGS公司)。根据其1999年2月公布的消息，在功能基因组研究领域，HGS公司己发现95％的人类cDNA；克隆了9000个人类分泌蛋白质的全长cDNA；发现了3000个基因的可能医学应用；发现了35个新的白细胞介素类分子和40个新的生长因子类分子；已有3个基因组药物进入临床。4）、寻找药物作用新靶点*基因组比较：抗微生物同源性搜索表达差异分析基因组研究促进了新靶标的发现：*理想的抗生素靶标应为微生物细胞存活所必须，在病原体中高度保守，且在人体中不存在或与人类基因有根本差异。生物信息学和人类基因组计划为药物靶标的发现和新药的研制开创了新天地，未来的药物设计将是基于生物信息学的知识挖掘的过程．通过数据分析首先确立靶标分子预测蛋白质分子结构设计药物分子与靶标分子相互作用5）、计算机辅助药物设计*计算机辅助分子建模，分子三维结构可视化。1982年，Dock程序已成功的有HIV蛋白酶抑制剂、二氢叶酸还原酶抑制剂等开发阶段：药物基因组学减少药物副作用避免开发风险（三）后基因组时代的生物信息学*随着人类基因组计划的顺利进行，人类全基因组测序工作已经完成。测序工作的完成并不代表基因组计划的结束，相反标志着“后基因组信息学”的开始。基因组学研究也由结构基因组转向了功能基因组的研究，通过对基因组的分析来了解生物体的功能成为后基因组时代的主要目标。后基因组时代，生物综合论将成为生物学的主流研究方法。人们在网络观点下、在分子相互作用网络水平理解生物学的基本原理。后基因组生物信息学有时也称为功能基因组系统学。功能基因组系统学的出现，是生物信息学领域的一个重大变化，它由主要以整理、储存、分析生物学数据或知识转变为综合多种生物分子及其相互作用的知识来了解生物系统的功能。010302后基因组研究对象的多层次性*后基因组研究对象是多层次的，人们从包括基因组（Genome）、转录组（Transcriptome）、蛋白质组（Proteome）、相互作用组（Interactome)、定位组（Localizome）、折叠子组（foldome）、代谢组（Metabolome）、表型组（Phenome）等方面，从组的角度研究各类生物学过程。如果说基因组问题涉及遗传图谱（Geneticmap）、限制性图谱（Restrictionmap）和物理图谱（Physicalmap），那么其它的组学涉及功能图谱（Functionalmaps）。但现在更加合理的看法是基因组只是细胞中分子之间相互作用的整个网络的一部分。基因组只是细胞指令的大仓库，相互作用网络本身才是那个所谓的指令系统，这个系统遵循固有程序引导发育过程，并产生生殖细胞。后基因组生物信息学是以对一系列生物学知识的综合为特征的，是在网络观点下、在分子网络层次上研究和理解生命的基本规律。功能基因组学发展趋势*功能基因组学发展的一个最新和重要领域是系统生物学（SystemsBiology），系统生物学研究问题有如下三个特点：1、更好整合生物过程不同阶段的分散数据如整合基因组、转录组、蛋白质组和代谢组的数据，得到对生物学过程的总体认识。另外一个方面是为了满足整合数据库的复杂查询。2、对复杂生物过程的更好