不同纬度梯度入侵植物一年蓬遗传多样性与遗传结构研究.pdfVIP

摘要

遗传和进化过程是影响外来入侵物种成功定殖和扩散的重要驱动力，入侵植物因其

生长旺盛、繁殖速度快、竞争力强等特点，对入侵地的生态环境和农业生产构成了严重

威胁。对入侵种的遗传多样性和居群遗传结构进行研究，能够了解入侵种的遗传背景，

为入侵种的分子生态学机制研究奠定基础，为制定有效的管理措施提供了理论依据。

一年蓬（Erigeronannuus（L.）Pers.）作为我国分布较广的农田杂草之一，代表了

我国入侵植物的典型案例，对我国农林生态系统和经济发展造成了严重破坏。然而目前，

对一年蓬种群的遗传和进化过程研究比较明显不足。因此，本研究利用GBS

（Genotyping-by-sequencing）技术研究12个不同地理纬度梯度的48份一年蓬样本，开

发其SNP位点，探讨入侵我国不同纬度梯度范围内一年蓬的遗传多样性水平和种群结

构，旨在了解入侵植物一年蓬的分子遗传背景，为一年蓬这一全国性有害杂草的入侵动

态提供新的证据。同时对12个纬度梯度的8种环境因子进行相关性分析，并探讨不同

种群遗传多样性与环境因子的相关性，主要结论如下：

（1）48份质检合格的一年蓬基因组DNA用于GBS文库构建和测序（30×），

共获得有效数据98.34Gb，高质量SNP位点为207422个，Q20≥95.84%、Q30≥89.04%，

GC含量分布在37.35%～40.46%。

（2）来自不同地区一年蓬群体的平均有效等位基因数（Ne/Ae）为1.2716个，观测

等位基因数（Na）为1.0769～1.3572，平均多态性位点数（PLN）为151029，多态性位

点数（PLN）最少的是绍兴（SX）群体（33600），最多的是通化（TH）群体（207224），

多态性位点比率（PPL）为29.83%～85.93%，平均多态位点百分率为39.59%，表明12

个一年蓬群体多态性较高，最小等位基因频率（Maf）介于0.3043～0.317，各群体观测

杂合度（Ho）与期望杂合度（He）变化范围分别为0.0742～0.3438和0.1151～0.3329，

基因多样性指数（Nei）为0.1374～0.388，香农指数（Shi）为0.1697～0.4901，牡丹江

（MDJ）群体遗传多样性最高，唐山（TS）群体遗传多样性最低，这表明不同纬度梯度

的一年蓬种群遗传多样性之间具有一定差异，整体遗传多样性处于中等水平；遗传距离

（GD）0.0955～1.9129，表明群体间的遗传距离差异较大。

（3）进化树分析结果显示来自12个不同地区的一年蓬群体可被分为4个亚群，牡

丹江（MDJ）、绍兴（SX）、沈阳（SY）各一个亚群，延边朝鲜族自治州（YB）、泰

安（TA）、枣庄（ZZ）、唐山（TS）、通化（TH）、盐城（YC）、南京（NJ）、苏

州（SZ）、上海（SH）为一个亚群，整体表现为各居群内的样本聚在一起，表明这9

个地区一年蓬群体亲缘关系较近，呈现出一定的地理分布规律性，主成分分析和群体遗

传结构分析结果与进化树结果相一致。

（4）通过对12个不同纬度的8个环境因子进行主导环境因子及主成分分析发现，

温度是影响一年蓬分布的主导环境因子，一年蓬种群对温度的适应范围较大；可能会继

续向气温较低的地区扩散蔓延。同时，对12个不同纬度一年蓬群体遗传多样性与其环

境因子进行相关性分析，发现二者之间的相关性并不显著。

关键词：一年蓬；简化基因组测序；单核苷酸多态性；遗传多样性；群体遗传结构

Abstract

Geneticandevolutionaryprocessesareimportantdrivingforcesthatinfluencethe

successfulcolonizationandspreadofinvasivealienspecies.Invasivealienplantsoftenposea

majorthreatduetotheirgrowthandhighcompetitivenessthataffectstheecologyand