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摘要
海洋微生物在食品、医药、工业、农业等方面的应用越来越广泛,被认为是产生
新型生物活性物质的重要资源库。本课题针对前期从海水中分离出来的一株放线菌,
进行了形态学及16SrDNA鉴定,并将其命名为Nocardiopsissp.HM-01。随后对该菌
株的生长特征及抑菌特性进行研究,并对其亲缘关系较近的菌株构建泛基因组,评估
了该物种种群的代谢特征并对其次级代谢产物基因簇进行预测,推断潜在的抑菌物质。
最后结合超高效液相色谱-质谱联用技术对抑菌代谢物进行了鉴定,提出了
Nocardiopsissp.HM-01抑菌作用机制。
116SrDNA
()通过对菌株微观形态下的孢子、菌丝形态的观察及序列比对,该
NocardiopsisNocardiopsissp.HM-01
菌株被鉴定为拟诺卡氏菌属(),并将其命名为。
随后选取6种固体平板培养基进行了考察,并确定了菌株生长良好的培养基:RP培
养基和ISP培养基。之后对该菌株进行了高盐耐受测试,发现该菌株可在高达8%NaCl
的盐浓度下生存。
2Nocardiopsissp.HM-01
()考察了不同液态发酵时间下乙酸乙酯提取物对细菌
的抑制效果,结果显示,随着培养时间的增加,其对细菌的抑菌作用也逐渐增强,抑
9
菌效果在第天时达到最高,之后有下降趋势,但仍维持较高的抑菌效果;且对革兰
氏阳性菌(金黄色葡萄球菌)的抑制效果较革兰氏阴性菌(大肠杆菌)更为显著。
(3)在抑菌谱测定中,本研究发现,乙酸乙酯萃取的发酵液提取物对大肠杆菌、
金黄色葡萄球菌、鳗弧菌、鹰钩肠杆菌及铜绿假单胞菌具有强烈的抑制效应,而发酵
液无法对细菌产生抑制作用;同时,发酵液本身对木霉菌、灰霉菌等均有显著的抑制
活性,但乙酸乙酯萃取物对真菌却无法达到抑制效果。
4Nocardiopsissp.HM-0119
()通过对亲缘性较高的个基因组(平均核酸同一
性94%)进行了分析,评估了该物种潜在的营养代谢特征。泛基因组分析结果显示,
该物种具有从外界获得新的基因的开放性特征,能够为物种提供丰富的遗传资源库;
同时具备较保守的核心基因组,其中包含丰富的碳水化合物活性酶类以及β-内酰胺酶
类耐药性基因。
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()对上述拟诺卡氏菌基因组序列进行了次级代谢产物基因簇预测,推断出
个潜在的抑菌物质基因簇,进一步采用超高效液相色谱质谱联用仪对-Nocardiopsissp.
HM-01的发酵液及乙酸乙酯粗提物进行检测分析,鉴定出主要的抑菌活性物质为:
desferrioxamineE和icosalideB。
总之,本研究通过对海洋放线菌Nocardiopsissp.HM-01的形态学、抑菌效应、
抑菌谱的考察,初步揭示了该物种在抑制微生物,尤其是抑制原核微生物方面的潜在
价值,并通过基因组学挖掘技术,评估了该物种的基础代谢特征,并结合质谱技术对
抑菌化合物进行了验证,本文的发现将为该菌株在抑菌领域的应用奠定基础。
关键词:拟诺卡氏菌;泛基因组;次级代谢产物基因簇;抑菌谱;超高液相色谱
-质谱
ABSTRACT
Marinemicroorganismsareincreasinglybeingusedinfood,medicine,industry,
agricultureandareconsideredimport
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