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9.RNAPⅠ和Ⅲ转录的调控及产物加工
RNA聚合酶Ⅰ介导的转录调控及rRNA的加工
。
rDNA的结构
ClassⅠ启动子(rRNA前体基因的启动子)
核心元件(Coreelement)
上游启动子元件(Upstreampromoterelement,UPE)
ClassⅠ启动子的特点
物种之间序列差异较大(与ClassⅡ启动子相比)
UPE和Core两个元件之间的距离很重要,缩短或延长两个元件之间的距离都可能会影响启动子的活性
Ⅰ类因子(RNA聚合酶Ⅰ所需通用转录因子)
核心结合因子(人类称SL1,其它生物称TIF-ⅠB)
人类SL1由TBP(TATAbox结合蛋白)和3种TAFs(TAFⅠ110,TAFⅠ63,TAFⅠ48)组成;并不直接与启动子结合,但它能加强UBF和PolⅠ与启动子的结合。
SL1是基础转录活性是必需的,而UBF能进一步增强转录活性
上游元件结合因子(upstream-bindingfactor,UBF)
人UBF由2条多肽构成(97kD和94kD),能与Ⅰ类启动子的Core(核心元件)及UPE(上游启动子元件)结合,再与SL1一起,促进转录。
RNA聚合酶Ⅰ的enhancer(UPE)、Activator(UBF)
rRNA转录起始模型
SL1决定了物种特异性,鼠源SL1只能识别鼠的rRNA启动子,而不能识别人的。
RNA聚合酶1的转录终止
。
哺乳动物rRNA的加工
。
rRNA的修饰
碱基甲基化
假尿苷化
核糖甲基化
小核仁RNA(snoRNA)介导rRNA的加工和修饰
rRNA的加工在核仁
长度为60~300个核苷酸的小RNA,主要存在于核仁中。
C/DboxsnoRNAs
H/ACAboxsnoRNAs
功能
一些snoRNA参与溶核酸(的)对rRNA原始转录本的加工。
大多数snoRNAs作为向导RNA参与核糖体RNA和一些剪接体RNA的转录后修饰。
snoRNA来自哪里?
rRNA的转录与加工相偶联
RNA聚合酶III介导的转录调控及tRNA的加工
。
ClassⅢ启动子
分类
典型的ClassⅢ启动子在基因内部
“非典型”ClassⅢ启动子类似于ClassⅡ启动子(如U6snRNA和7SKRNA的启动子)
Ⅲ类因子(RNA聚合酶Ⅲ所需通用转录因子)
包括TFⅢA、TFⅢB、TFⅢC
TFⅢB和TFⅢC是所有在基因内部有ClassⅢ启动子的基因PIC组装所必需的(典型III类基因);
5SrRNA基因的PIC的组装还需要TFⅢA。
TFⅢA和TFⅢC是能够结合内部的启动子,帮助TFⅢB结合到转录起始位点上游。
TFⅢB包含TBP(TATAbox结合蛋白)(均在转录起始位点上游)及一些TAFⅢs(如BRF1,BRF2和BDP);
ClassⅢ启动子上的转录预起始复合物(PIC)
TBP在3类启动子转录起始复合物组装中的作用
RNA聚合酶Ⅲ的转录终止
真核细胞tRNA的加工
前述
在大多数真核细胞中,tRNA基因在染色体聚集成簇,并非常靠近端粒
每个基因簇包含50-200个tRNA基因,每个基因簇tRNA的种类和数量不一
tRNA基因的启动子位于基因内部,由RNAPolIII转录。
酵母含有约250个tRNA基因,人有约2000个tRNA基因。
。
1.用含有催化RNA的核糖核蛋白RNaseP去除5′端的前导序列(紫色)。通过RNaseZ去除3′端拖车序列(紫色)。通过剪接去除内含子。
tRNA内含子的剪接
2.CCA三核苷酸通过t-RNA特异性转核苷酸酶在3′端添加。
3.碱基的修饰。
tRNA的修饰(极其丰富)
在嘌呤碱基的杂环上添加甲基和异戊烯基。
任一残基的核糖中2′-OH基团的甲基化。
将特定的尿苷转化为二氢尿苷、假尿苷或核胸苷残基
氨酰tRNA合成酶将氨基酸与tRNA相连
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