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经典锌指的三维结构:一个β-折叠和一个α-螺旋2组蛋白的甲基化(与基因失活有关)3DNA的甲基化(与基因失活有关)1组蛋白的乙酰化(与基因活化有关)修饰作用与染色质状态的关系:失活状态01活化状态02组蛋白乙酰化03组蛋白脱乙酰化04组蛋白脱甲基化05组蛋白甲基化06DNA脱甲基化07DNA甲基化在基因调控的众多环节中,转录起始的调节居于首要地位。与原核基因相似,真核基因的开关同样由特殊的DNA序列与DNA结合蛋白所控制。参与转录调节的蛋白因子从功能上可分为3类:基础转录因子(或称通用因子):广泛分布于各种细胞类型,与核心启动子相结合,在转录起点附近和RNA聚合酶共同组成基础转录反应器。如TBP因子第二节真核生物基因的转录调节真核生物的RNA聚合酶细胞核内,有三种:区别在于对α-鹅膏蕈碱的敏感性不同。此外,线粒体、叶绿体中也含有RNA聚合酶,其特性类似原核细胞中的RNA聚合酶,它们都是经过核基因编码、在细胞质中合成后再输送过去的。酶位置主要转录产物相对活性对α-鹅膏蕈敏感性RNA聚合酶I核仁18S、5.8S、28SrRNA50%~70%不敏感RNA聚合酶II核质mRNA前体、snRNA20%~40%敏感RNA聚合酶III核质tRNA、5SrRNA和其他snRNA约10%介于聚合酶I和II之间以前认为与TATA盒结合的蛋白因子是TFⅡ-D,后来发现TFⅡ-D实际包括两类成分:TBP(TATAboxbindingprotein):是唯一能识别TATA盒并与其结合的转录因子,是三种RNA聚合酶转录时都需要的;TAF(TBP相关因子,TBP-associatedfactors):至少包括8种能与TBP紧密结合的因子。1上游因子:遍布各种细胞并呈组成型表达,通过特异结合上游启动子序列提高基础转录的水平。2组成型表达:基因在所有情况下都以相同速度进行的表达,即无需诱导即可实现的基因表达。3构成细胞基本组分的基因和细胞基本代谢相关基因通常以这种方式表达,以使细胞的基本功能得以维持。可诱导因子:也属序列特异性结合蛋白,但它们的合成或激活过程受到细胞类型或发育时期的严格控制,并能对来自细胞或外界的信号作出迅速而准确的反应,进而从时间和空间上调节基因的转录,可诱导因子的识别序列又被称为应答元件。真核启动子间不像原核那样有明显共同一致的序列,而且单靠RNA聚合酶难以结合DNA而起动转录,而是需要多种蛋白质因子的相互协调作用。真核启动子一般包括转录起始点及其上游约100~200bp序列,包含有若干具有独立功能的DNA序列元件,每个元件约长7~30bp。一、基础转录及其调节1.启动子、RNA聚合酶和基础转录因子RNA聚合酶Ⅱ的启动子(promoter)25bp含TATA序列(TATA框,Hogness框)作用:选择转录起点、控制转录精确性。75bp含GGCCAATCT序列(CAAT框)作用:控制转录起始频率。在-80~-110bp区含有GCCACACCC或GGGCGGG序列(GC框)作用:调控起始和转录效率。真核与原核生物启动子的比较:增强子---GC---CAAT----TATAA—5mGpp—起始位点110-70-25真核生物原核生物TTGACA---TATAAT------起始位点35-10哺乳类RNA聚合酶Ⅱ启动子中常见的元件元件名称共同序列结合的蛋白因子名称分子量DNA长度TATATATAAATFIID30,000~10bpGCGGGCGGSP1105,000~20bpCAATGGCCAATCTCTF/NF160,000~22bpkBGGGACTTTCCNFkB44,000~10bpATFGTGACGTATF?~20bpOctaneATTTGCATOct-176,000~10bp核心启动子(corepromoter):指RNA聚合酶起始转录所必需的最小的DNA序列,包括转录起始点及其上游-25~-30bp处的TATA盒。TATA盒位置极为保守,是许多通用转录因子的装配位点。01核心启动子单独起作用时只能确定转录起始位点和产生基础水平的转录。02启动子中的元件可以分为两种:转录起始点没有广泛的序列同源性,但多数转录本的第一个碱基为腺嘌呤,其两侧是嘧啶碱
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