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生物信息学软件：CLC Genomics Workbench二次开发_（4）.基因组比对与注释.docx

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    基因组比对与注释

    基因组比对的原理

    基因组比对是生物信息学中的一项基本任务，用于将读段（reads）与参考基因组进行匹配，从而确定这些读段在基因组中的精确位置。CLCGenomicsWorkbench提供了强大的比对工具，可以处理大规模的测序数据，并支持多种比对算法。基因组比对的原理主要包括以下几个步骤：

    读段预处理：在比对之前，通常需要对读段进行预处理，包括去除低质量的碱基、接头序列和重复序列等。这些预处理步骤可以提高比对的准确性和效率。

    构建索引：为了加速比对过程，CLCGenomicsWorkbench会先对参考基因组构建索引。索引的构

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