分子生物学新技术及其应用.pptVIP

分子生物學新技術及其應用第一節代謝組學及其研究進展什麼是代謝組學？代謝組學研究方法代謝組學分析技術氣相色譜-質譜聯用技術（GC-MS）液相色譜-質譜聯用技術（LC-MS）毛細管電泳-質譜聯用技術（CE-MS）核磁共振技術（NMR）一、代謝組學的概念組學時代基因表達基因組轉錄組蛋白質組代謝組學第一節代謝組學及其研究進展代謝組學研究什麼？？生物體系（細胞、組織或生物體）代謝產物發生變化（種類，隨時間變化）特定基因突變環境變化生物體系代謝組學研究對象第一節代謝組學及其研究進展體內各種物質代謝過程互相聯繫形成一個整體糖類脂類蛋白質水無機鹽維生素各種物質代謝之間互有聯繫，相互依存。消化吸收中間代謝廢物排泄第一節代謝組學及其研究進展機體物質代謝不斷受到精細調節機體有精細的調節機制，調節代謝的強度、方向和速度內外環境的變化對機體代謝造成影響適應環境的變化精細的調節控制第一節代謝組學及其研究進展普遍定義代謝組學：通過考察生物體系（細胞、組織或生物體）受刺激或擾動後（如將某個特定的基因變異或環境變化後），其代謝產物的變化或其隨時間的變化，來研究生物體系的一門科學。研究對象：相對分子品質小於1000的內源性小分子。代謝物小分子類別：多肽、氨基酸及其衍生物、胺、脂類、金屬離子。第一節代謝組學及其研究進展特點1.關注於內源性小分子化合物。2.對生物體系中的小分子化合物進行定性定量研究3.內源性小分子化合物的上調和小調指示了與疾病、毒性、基因修飾或環境因數的影響。4.內源性化合物的特點用來表徵疾病和藥物篩選。第一節代謝組學及其研究進展研究方法研究步驟：生物組織，體液經滅活預處理多個方法聯用第一節代謝組學及其研究進展應用：藥物研發疾病研究植物代謝組學微生物代謝組學中藥現代化第一節代謝組學及其研究進展連接圖資料庫ConnectionsMapDB京都基因與基因組百科全書KEGG(http://www.genome.jp/kegg/ligand.html)生物化學途徑ExPASy互聯網主要代謝途徑mainmetabolicpathwaysonInternert,MMPDuke博士植物化學和民族植物學資料庫Arizona大學天然資料庫Wiley_handbookofgc-ms新藥及其代謝產物質譜庫http://www.ualberta.ca/_gjones/mslib.htm“腫瘤”代謝組資料庫Pubmed化合物資料庫NIST質譜資料庫/srd/nistl.htm一些有用的資料庫：第一節代謝組學及其研究進展分析技術1.氣相色譜-質譜聯用技術（GC-MS）工作原理：氣相色譜儀介面質譜儀常壓高真空離子源品質分析器檢測器第一節代謝組學及其研究進展幾種新的GC-MS技術全二維氣相色譜質譜技術（GC×GC-TOFMS）全二維氣相色譜：氣化室檢測器色譜柱1色譜柱2調製器第一節代謝組學及其研究進展檸檬水中檸檬烯的手性化合物分析只能看到一個峰色譜圖_柱1(檢測器:FID)色譜圖_柱2(檢測器:MS)切換到第二根色譜柱第一節代謝組學及其研究進展研究實例：用LecoChromaTOFsoftware得到的質荷比為73（m/z）的離子碎片典型GC×GC-TOFMS二維血漿色譜圖（AnalyticaChimicaActa，2009，633，257-262）第一節代謝組學及其研究進展2.液相色譜-質譜聯用技術（GC-MS）工作原理：液相色譜儀介面質譜儀常壓高真空離子源品質分析器檢測器第一節代謝組學及其研究進展液相色譜-質譜聯用的新技術4000QTrapLC/MS/MS第一節代謝組學及其研究進展YangJun等運用安捷倫公司的高效液相色譜系統配合API公司的Q-TRAPLC液相質譜系統。研究50個健康人和慢性乙肝病人的血清樣本，經過脫蛋白處理。經過去噪音，峰型尖銳化等處理。使用PLS-DA處理代謝數據，研究確定了代謝物標記分子。（JournalofProteomeResearch,2006,5,554-561）下圖為分析結果：使用PLS-DA處理代謝數據正常組和慢性乙肝組對照（JournalofProteomeResearch,2006,5,554-561）第一節代謝組學及其研究進展新型液相色譜技術UPLC新型超高液相色譜儀第一節代謝組學及其研究進展HP