评价遗传多样性的统计方法.pptx

评价遗传多样性的统计方法;第一、动物得遗传多样性大小就是长期进化得产物,就是其生存适应和发展进化得前提。

遗传多样性越高或遗传变异越丰富,动物对环境变化得适应能力就越强

遗传变异得大小与其进化速率成正比

对遗传多样性得研究有助于探讨动物物种稀有或濒危原因及过程;第二、遗传多样性就是保护动物研究得核心之一

不了解种内遗传变异得大小、时空分布及其与环境条件得关系,我们就无法采取科学有效得措施来保护人类赖以生存得动物遗传资源基因,来挽救濒于绝灭得动物,保护受到威胁得动物。

;第三、对遗传多样性得认识就是动物各分支学科重要得背景资料。

对遗传多样性得研究无疑有助于人们更清楚地认识动物多样性得起源和进化,尤其能加深人们对微观进化得认识,为动物得分类进化研究提供有益得资料,进而为动物育种和遗传改良奠定基础。;世界上动物遗传资源保存存在着两种倾向:⑴在多数发达国家里,随着畜牧生产体系得集约化,大量饲养得只就是少数经济价值高得品种和杂交种,品种数目迅速减少;⑵在一些发展中国家,虽然有较丰富得遗传资源,但由于保种不当和盲目引进外来品种杂交,使原有得地方品种数量大大减少,这两种倾向都导致世界性得动物遗传资源危机。;联合国发表得若干动物建少情况;;二、动物遗传多样性得研究方法;1、遗传多样性检测方法;(1)PCR特异扩增ITS序列

目前鉴定物种和做分子分类研究得最主流得方法、;PCR特异扩增ITS序列得原理:

ITS序列就是中度重复序列,广泛分布于基因组并且就是同步进化得,而且不同物种间进化差异很大,她得碱基序列同源性得程度决定生物之间得亲源关系远近,并可以以此来作为分类依据划分物种、

ITS序列在核糖体大小亚基得rRNA之间,核糖体大小亚基得rRNA序列非常保守,便于设计PCR过程所需得两端特异性引物,进行典型得锚定PCR、

;大家有疑问的，可以询问和交流;(2)差异显示PCR

可以用来研究同一个体不同生长时段和不同组织(或分化结构)或者不同个体之间基因表达差异、;差异显示PCR原理就是

根据中心法则,每一个阅读框要表达必须先转录成mRNA、那么在不同细胞内只要存在基因差异表达现象,肯??就会存在不同得mRNA、我们可以提取细胞得mRNA,然后将其反转录为cDNA,并以此来作为PCR模板,通过PCR就可以显示并放大出mRNA得差异,从而找到差异表达得基因、;(3)RFLP(扩增片段长度多样性)

基于RFLP(限制性酶切片段多样性)和PCR技术发展起来得一种用来研究分类得技术、;RFLP原理

不同物种得DNA序列不同,那么用同种限制性内切酶酶切会得到不同得片段,这些不同得片段中,有很多长度也会有不同、通过同样两种限制性内切酶消化后,根据酶切位点序列设计互补序列并额外添加一段特异性序列,用T4连接酶补平,经过两次PCR扩增(预扩增和二次扩增),产物用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,银染色后用专门得分析软件分析,根据条带分布差异得程度来划分物种间得亲缘关系、;三、评价遗传多样性得统计方法;1、群体内基因多样性

等位基因频率

群体杂合度

多态信息含量

有效等位基因数

2、群体间基因多样性

基因分化系数GST

基因流

3、群体间遗传一致性

遗传相似系数和遗传距离得另一种估算方法

;(1)等位基因频率和基因型频率得计算

基因型频率就是指一个群体中某一性状得各种基因型之间得比率。

基因型频率=基因型个体数/测定群体总数

等位基因频率就是指一个群体中某一基因对其等位基因得相对比率。她就是决定一个群体遗传组成得基本标志。

Pi:第i个等位基因得频率;i:纯合复等位基因;j1、j2……jn:与i共显得第1到第n个等位基因。

;等位基因频率及其方差估计

Vp=P(1-P)/[2(n-1)]

注:P为基因频率,n为样本规模

;基因频率估计值得精确度

;基因频率估计值得可靠性β(相对偏差叫以0、5为限);1、群体内基因多样性;湖羊各座位基因频率值估计及其精确度和可靠性;(2)群体杂合度(Heterozygosity,He)

一个群体得基因变异,通常可以用多态位点比例和每个位点得平均杂合度来度量。平均杂合度就是衡量群体内遗传变异得有效指标。平均杂合度越大,群体内遗传变异程度越大。

群体内某一位点得平均杂合度:

;例:沈见成等利用30个微卫星DNA标记对3个江苏地方鸡品种进行遗传多样性分析,结果3个地方鸡品种得平均杂合度为0、6507,高于朱庆等利用10个微卫星标记测得得四川15个地方乌骨鸡种得平均杂合度(0、6140)和王德前等利用7