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基于转录组日本沼虾SSR分子标记的挖掘与分析
摘要：通过对日本沼虾肝胰腺组织转录组测序获得的22,043条Unigene进行SSR位点的检测与分析，共检测出18,303个SSR位点，分布在8,345条Unigene上，发生频率37.85%。其中，主要的重复单元为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复，占日本沼虾总SSR的93.12%。单核苷酸重复基序中几乎全为A/T，二核苷酸重复单元主要为AC/GT、AG/CT以及AT/TA，三核苷酸重复单元大多为AAT/ATT、AGC/CTG、AGG/CCT和AAG/CTT。多态性分析研究发现，Ⅱ型SSR（长度5～20b
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