特发性非肝硬化门静脉高压症的关键基因通路筛选与潜在中药预测.docx

特发性非肝硬化门静脉高压症的关键基因通路筛选与潜在中药预测

刘玥佩钟颖张萍杨冉潋李雷益

[摘要]?目的?采用生物信息学方法对特发性非肝硬化门静脉高压症（idiopathic?non-cirrhotic?portal?hypertension，INCPH）的基因芯片数据进行分析，获取疾病发生发展的关键基因和信号通路，预测治疗INCPH的潜在中药。方法?从基因表达综合数据库（gene?expression?omnibus，GEO）数据库下载关于INCPH的基因芯片数据集GSE77627，利用R语言对数据进行标准化并筛选INCPH的差异基因（differential?genes，DEGs），并利用Metascape数据库对所有DEGs进行基因本体（gene?ontology，GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto?encyclopedia?of?genes?and?genomes，KEGG）富集分析，并通过STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络；同时，利用CytoHubba插件筛选Degree值排名前15的DEGs作为关键基因。随后将关键基因与医学本体信息检索平台互相映射，以P0.05为标准筛选治疗INCPH的潜在中药，并从TCMSP数据库中筛选潜在中药有效成分，导入Cytoscape软件构建中药相关网络图，并预测关键作用靶点。结果?共获得1880个DEGs，其中表达上调