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口腔疾病防治2025年5月第33卷第5期
·345·
JournalofPreventionandTreatmentforStomatologicalDiseases,May2025,Vol.33No.5http://www.
[DOI]10.12016/j.issn.2096⁃1456.202440461·基础研究·
基于缺氧相关基因的头颈部鳞状细胞癌分子分类
及STC2的临床意义
1123
朱嘉宁,王天天,张瑞,宋红权
1.哈尔滨医科大学口腔医学院,黑龙江哈尔滨(150000);2.黑龙江省医院南岗院区口腔科,黑龙江哈尔滨
(150000);3.哈尔滨医科大学附属第一医院口腔颌面外科,黑龙江哈尔滨(150000)
【摘要】目的基于缺氧相关基因(hypoxia⁃relatedgenes,HRGs)表达谱构建头颈部鳞状细胞癌(headand
necksquamouscellcarcinoma,HNSCC)分类系统,并探讨缺氧基因斯钙素2(stanniocalcin2,STC2)的临床病理
特征及生物学功能。方法从癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)数据库中获取546例HNSCC
样本的转录组数据及临床信息,基于200个HRGs的表达谱,采用非负矩阵分解(non⁃negativematrixfactoriza⁃
tion,NMF)识别HNSCC亚类,通过比较亚类间的肿瘤突变负荷、功能富集分析、药物敏感性及临床特征,评估
各亚类的分子特征及预后差异。采用LASSO⁃Cox回归筛选预后相关基因并构建预后模型。利用TCGA数据
库中口腔鳞状细胞癌(oralsquamouscellcarcinoma,OSCC)相关数据,分析STC2在OSCC与对照样本中的表达
差异,利用qRT⁃PCR和免疫组化检测OSCC样本中STC2的mRNA和蛋白表达;在CAL⁃27细胞中敲低STC2,通
过qRT⁃PCR和Westernblot验证敲低效率,并通过CCK⁃8实验和细胞划痕试验评估STC2对细胞增殖和迁移能
力的影响。结果基于HRGs表达谱,HNSCC被分为了3个亚类(C1、C2、C3)。C1亚类缺氧活性中等,预后良
好;C2亚类缺氧活性最高,预后差,且对CTLA⁃4抑制剂敏感(P<0.05);C3亚类缺氧活性最低,预后中等,
STC2属于C3亚类。HNSCC中细胞周期依赖性激酶抑制剂2A(cyclin⁃dependentkinaseinhibitor2A,CDKN2A)、
磷脂酰肌醇⁃4,5⁃二磷酸3⁃激酶催化亚基α(phosphatidylinositol⁃4,5⁃bisphosphate3⁃kinasecatalyticsubunitalpha,
PIK3CA)和肿瘤蛋白p53(tumorproteinp53,TP53)突变频率较高,C1亚类的基因组增益和缺失负担显著高于
C3亚类(P<0.05),而C2亚类的基因组增益显著高于C3亚类(P<0.05)。C2亚类显著富集于甘氨酸代谢、碱
基切除修复等缺氧相关通路(P<0.05),提示其独特的分子特征。C1、C2和C3亚类在性别(男性)(Cramers
V=0.15)、辐射暴露(CramersV=0.12)、药物治疗(CramersV=0.18)及病理分级(G1/G2)(CramersV=0.25)
方面均呈显著正相关(P<0.05)。通过LASSO⁃Cox回归筛选出9个预后相关基因,其中STC2的高表达与HN⁃
SCC患者较差的总
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