拟南芥和水稻葡萄糖磷酸变位酶基因家族的生物信息学分析.pdfVIP

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分子植物育种,2025年,第23卷,第3期,第705-713页

MolecularPlantBr2

,No.3,705-713

研究报告

ResearchReport

拟南芥和水稻葡萄糖磷酸变位酶基因家族的生物信息学分析

1

孙敬彭!于耸12郑志民2*

曹丽!王晗慧2

1东北林业大学生命科学学院,东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室,哈尔滨,150040;2东北林业大学林学院,林木遗传育种国家重点

实验室,哈尔滨,150040

*通信作者,zmzheng@

摘要葡萄糖磷酸变位酶(phosphoglucomutase,PGM)属于磷酸已糖变位酶家族,其主要功能是高度特异

的催化葡萄糖-1-磷酸(Glc-1-P)和葡萄糖-6-磷酸(Glc-6-P)的相互转化,尤其在蔗糖的代谢和淀粉的合成

中发挥着至关重要的作用。为了进一步研究单子叶和双子叶植物中PGMs基因家族的功能,本研究以拟南

芥和水稻为代表,采用生物信息学的手段,详细地分析了AtPGMs和OsPGMs基因家族的理化性质、蛋白质

结构、亚细胞定位、保守基序、系统进化以及组织表达特异性情况。结果表明,拟南芥和水稻中的PGMs基因

家族具有较高的相似性,AtPGMs和OsPGMs编码的蛋白均为亲水性蛋白。系统发育树分析显示,AtPGMs和

OsPGMs家族基因在进化上分成两个大的分支,并且具有较高的保守性,均含有预测的8个保守基序;

AtPGMs和OsPGMs蛋白质均以无规卷曲和α-螺旋为主要的二级结构成分;蛋白质磷酸化预测结果显示,

磷酸化数目最多的均为丝氨酸,最少的均为酪氨酸。组织表达分析显示,拟南芥PGMs基因家族在幼苗、叶、

芽和角果中具有相对较高的表达量,OsPGMs在子房、胚和茎中具有相对较高的表达量。本研究为进一步探

索高等植物PGMs基因家族的生物学功能提供一定的理论基础和参考依据。

关键词PGMsArabidopsisthaliana)Oryzasativa);

;拟南芥(;水稻(基因家族;生物信息学

BioinformaticsAnalysisofPhosphoglucomutaseGeneFamilyofArabidopsis

andRice

CaoLi1WangHanhui?SunJingpeng!YuSongl2ZhengZhimin2*

1KeyLaboratoryofSaline-alkaliVegetationEcologyRestoration(MinistryofEducation),CollegeofLifeScience,NortheastForestryUniversity,Harbin,

150040;2StateKeyLaboratoryofTreeGeneticsandBreeding,CollegeofForestry,NortheastForestryUniversity,Harbin,150040

*Correspondinauthor.mzheng@

DOI:10.13271/j.mpb.023.000705

AbstractPhosphoglucomutases(PGM)belongtothephosphohexomutasessuperfamilyandtheirmainfunctionis

highlyspecificallycatalyzingtheinterconversionofglucose-1-phosphate(Glc-1-P)toglucose-6-phosphate(Glc-

6-P),especiallyinsucrosemetabolismandstarchsynthesis.InordertofurtherstudythefunctionsofthePGMs

genefamilyinmonocotyledonanddicotyledon,takingArabidopsisandriceasrepresentatives,thephysicaland

chemicalproperties,protein

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