大豆GmHSF21基因的生物信息学分析.pdfVIP

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研究与探讨

图分类号:S565.1文献标识码:A文章编号:1674-3547(2024)01-0013-08

doi:10.20095/j.issn1674-3547.2024.01.003

大豆基因的生物信息学分析

123,41111**1

宋勇泽,刘汝翠,朱永胜,月,姜妍,佟晓红,王绍东,王遂

(1.北农业大学农学院,哈尔滨150030;2.克禹王大豆蛋白食品有限公司,黑龙江克164800;

3.黑龙江九阳豆业有限公司,黑龙江大庆166200;4.杭州九阳豆业有限公司,杭州310018)

摘要:植物热激转录因子(Heatshocktranscriptionfactor,HSFs)在参与高温、干旱及盐碱等逆境胁迫方面发

挥重要作用。为探究大豆基因在盐胁迫应答中的作用,文章以大豆品种中黄13前期盐胁迫处理下的

转录组差异基因数据为研究对象,对大豆基因家族中的候选基因进行生物信息学分析。结果表

明,属大豆基因家族中的A亚族,共编码341个氨基酸,其编码区存在4处多态性位点,具有

保守的HSF和HSFDNA-binding基序。系统发育分析表明,与亲缘关系。顺式作用原件

分析表明该基因启动子区具有响应多种生物及非生物胁迫的作用元件。荧光定量PCR结果显示该基因在盐胁迫

条件下表达量上调,与转录组结果基本一致。

关键词:大豆;家族;盐胁迫;生物信息学分析

收日期:2023-08-28;修回日期:2023-09-12

第一作者:宋勇泽(1999年—),男,硕士研究,研究方向为大豆作物遗传育种。E-mail:songyongze0425@163.com

*基金项目:黑龙江省重点研发项目课题—优异种质利用及新品种选育(2022ZX02B05-4);国家科技部“十四五”子课题—优

质大豆新种质创制与应用(2021YFD1201103-01-04)

**通讯作者:王绍(1966年—),男,博士,教授,研究方向为大豆品质生物学与遗传改良。E-mail:wsdhlj@

輥輱讂

研究与探讨

BioinformaticsAnalysisofGeneinSoybean

123,411

SONGYongze,LIURucui,ZHUYongsheng,LIYue,JIANGYan,

111

TONGXiaohong,WANGShaodong,WANGSui

(1.CollegeofAgriculture,NortheastAgriculturalUniversity,Harbin1500

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