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第41卷第5期黑龙江大学自然科学学报Vol.41No.5
2024年10月JOURNALOFNATURALSCIENCEOFHEILONGJIANGUNIVERSITYOctober,2024
D0I:10.13482/j.issn1001-7011.2024.03.103投稿网址:
甜菜小G蛋白BvRAC基因家族鉴定及生物信息学分析
刘妍含,陈学
(黑龙江大学生命科学学院农业微生物技术教育部工程研究中心/黑龙江省寒区植物基因与生物发酵重点实验室/
黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室,哈尔滨150080)
摘要:小G蛋白RAC(RAS-relatedC3botulinumtoxinsubstrates)基因家族参与植物生长、发育及
逆境胁迫调控过程,是植物信号转导领域的研究热点。为了探究甜菜BuRAC基因家族的功能与进
化关系,利用生物信息学方法对BuRAC基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、多序列比对、系
统进化、基因结构、染色体定位及共线性、启动子顺式作用元件、盐胁迫下的表达模式和蛋白互作网
络进行研究。分析结果表明,BuRAC基因家族有9个成员,有6~8个外显子,具有5个G结构域
(Gl~G5),1个SYR基序(S为Ser,Y为Tyr,R为Arg)、1个Rho插入序列和1个C端可变区。
BuRAC基因家族成员的启动子中含有多个激素和逆境应答元件;8个基因均响应盐胁迫;BvRAC蛋
白通过与鸟苷酸交换因子(GDPexchangefactor,GEF)、GTP酶激活蛋白(GTPaseactivatingprotein,
GAP)、鸟苷酸解离抑制因子(GDPdissociationinhibitor,GDI)、含有CRIB结构域的ROP相互作用
蛋白(ROP-interactiveCRIB-containingProtein,RIC)、蛋白磷酸酶2C
PP2C)等蛋白互作发挥调节甜菜生长及逆境应答功能。本研究为甜菜小G蛋白BuRAC基因家族
在甜菜生长发育和逆境胁迫下功能研究奠定了良好的基础。
关键词:甜菜;小G蛋白;BuRAC基因家族;生物信息学分析
中图分类号:S566.3文献标志码:A文章编号:1001-7011(2024)05-0553-10
GenomeidentificationandbioinformaticsanalysisofthesmallGTPase
BvRACgenefamilyinsugarbeet
LIUYanhan,CHENSixue
(EngineeringResearchCenterofAgriculturalMicrobiologyTechnology,MinistryofEducation/HeilongjiangProvincialKey
LaboratoryofPlantGeneticEngineeringandBiologicalFermentationEngineeringforColdRegion/KeyLaboratoryof
MolecularBiology,CollegeofHeilongjiangProvince,SchoolofLifeSciences,HeilongjiangUniversity,Harbin150080,China)
Abstract:ThesmallGTP-bindingproteinsRAS-relatedC3botulinumtoxinsubstrates(RAC)gene
familyisinvolvedintheregulationofplantgrowth,developmentandadversitystress,andisahot
r
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