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第25卷第5期中国食品学报Vol.25No.5
2025年5月JournalofChineseInstituteofFoodScienceandTechnologyMay2025
酸性磷酸酶的生物信息学分析及抑制剂筛选
郑婕,陈刘胤,楚晓燕,李颖畅*,李学鹏
(渤海大学食品科学与工程学院生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心辽宁锦州121013)
摘要肌苷酸(IMP)是核苷酸降解过程中的重要物质,也是水产品鲜味的呈味物质之一,在酸性磷酸酶的作用下降解为次
黄嘌呤核糖核苷(HxR)和次黄嘌呤(Hx),因此研究酸性磷酸酶的酶学特性和抑制其活性具有重要意义。基于生物信息学分
析酸性磷酸酶的酶学特性,并采用虚拟筛选技术筛选酶的抑制剂。结果表明:酸性磷酸酶ACPI和ACPI分别含有488个
和348个氨基酸,均为稳定的亲水蛋白。ACPI含有37个磷酸化位点和5个N-糖基化位点,而ACPII含有14个磷酸化位
点和1个N-糖基化位点,两者均不含O-糖基化位点。ACPI存在一个跨膜结构域,不存在信号肽,亚细胞定位于质膜中,而
ACPII不含跨膜结构域,含有1个信号肽,亚细胞定位于胞外基质中。ACPI和ACPII的二级结构中,无规卷曲和延伸链的
含量较高。ACPI和ACPII的最适温度均为40℃,最适pH值均为5.0,米氏常数Km分别为0.23mmol/L和0.14mmol/L,最
大反应速率mx分别为1.04μmol/(L·min)p-NP和1.06μmol/(Lmin)p-NP。筛选出表儿茶素没食子酸酯(ECG)、表儿茶
素、表没食子儿茶素没食子酸酯、没食子酸和水杨酸5种抑制剂,ECG对ACPI和ACPI的抑制作用最强,ICso值分别为
0.24mmol/L和0.27mmol/L。本研究为通过靶向控制ACP活性来改善水产品风味提供理论依据。
关键词虹鳟鱼;酸性磷酸酶;生物信息学;虚拟筛选
D0I:10.16429/j.1009-7848.2025.05.019
文章编号1009-7848(2025)05-0195-11
生物信息学是由数学、计算机科学、信息学和的虚拟筛选和基于结构的虚拟筛选[4。基于配体的
生物学产生的一门交叉学科,就是应用信息科学虚拟筛选技术是已知能与靶标结合的化合物或一
的理论、方法和技术,管理、分析和利用生物分子系列化合物的信息,采用相似度检索、定量构象关
数据,或者是一门利用计算机技术研究生物系统系模型、药效团等方法筛选出与已知信息具有相
之规律的学科叫。伴随着人类基因组计划的完成,似性质的其它化合物4。基于结构的虚拟筛选是利
生命科学研究进入后基因组时代,在此过程中产用基于受体的三维结构模型,通过数据库中的化
生了大量的蛋白序列、结构、功能以及互作的数合物与受体对接寻找最佳结合方式和亲和力的方
据,蛋白质组学更加庞大且复杂,仅仅依靠传统的法[5。Chao等[以α-淀粉酶为靶蛋白,利用分子对
生物手段无法解决问题,必须借助生物信息学技接技术从食药同源的植物中筛选出榭皮素、表儿
术全方位的处理所产生的生物学数据。杨明勇等[2]茶素没食子酸酯(ECG)、表没食子儿茶素没食子
分析斑马鱼肌肉Smydla蛋白生物信息学,发现酸酯(EGCG)、橙皮苷、异黄酮、二氢杨梅素等21
Smydla蛋白的氨基酸数量是489个,是一个亲水种抑制剂,结合酶活性抑制试验发现,ECG、EGCG
蛋白质。马聪聪等[3I研究发现,与新鲜对照组(Od)和原花青素对α-淀粉酶的抑制效果较好。基于
相比,3个贮存时间的三文鱼共有62种蛋白质发此,本文以生物信息学分析结合分子对接技术探
生显著变化,生物信息学分析发现这些蛋白主要究虹鱼酸性磷酸酶的酶学特性并进一步筛选其
富集在代谢通路和糖酵解/糖异生通路中。虚拟筛抑制剂为靶向控制ACP活性,旨在有效保留鱼肉
选是一种基于评估小分子与蛋白质结合可能性的鲜味提供理论依据。
计算机技术,具有速度快、成本效益高、通量高等
优点。虚拟筛选技术可分为2种类型:基于配体1材料与方法
1.1材料与试剂
收稿日期:2024-05-03
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