‘粤绿肥1号’紫云英转录组测序及生物信息学分析.pdfVIP

广东农业科学GuangdongAgriculturalSciences2025，52（3）：35-42DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2025.03.004

李静宇，顾艳，龚利萍，付子健，钟家豪，王继华.‘粤绿肥1号’紫云英转录组测序及生物信息学分析［J］.广东农业科学，2025，52（3）：35-42.

LIJingyu,GUYan,GONGLiping,FUZijian,ZHONGJiahao,WANGJihua.TranscriptomesequencingandbioinformaticanalysisofAstragalussinicus‘YuelvfeiNo.

1’［J］.GuangdongAgriculturalSciences,2025，52（3）：35-42.

‘粤绿肥1号’紫云英转录组测序及生物信息学分析

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李静宇，顾艳，龚利萍，付子健，钟家豪，王继华

（1.广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室/广东省道地南药资源保护

与利用工程中心，广东广州510640；2.广东花仙子生态农业科技有限公司，广东广州510670）

摘要：【目的】紫云英（AstragalussinicusL.）能固氮养地和改良土壤，是生态农业的核心物种。广东省推

广“冬种紫云英-春耕深翻”模式3万hm2，形成“绿肥-减排-增产”生态经济。紫云英种质资源开发对维持耕

地质量提升系统的可持续性具有战略价值。利用高通量测序技术和生物信息学方法分析紫云英的转录组和基因表

达特征，为紫云英的资源鉴定与利用提供遗传信息。【方法】提取‘粤绿肥1号’紫云英的根、茎、叶和种子的总

RNA，混合构建文库并进行高通量测序，组装获得紫云英的unigenes。通过序列注释和比对分析‘粤绿肥1号’紫

云英转录组特征。【结果】从‘粤绿肥1号’紫云英转录组中共鉴定出30792条unigenes，平均长度为1163bp，

N50值为1946bp。紫云英unigenes与鹰嘴豆（Cicerarietinum）具有最高序列相似性。在功能注释分析中，20930

条unigenes获得功能注释，其中KEGG和GO数据库分别注释13858条和17439条。GO注释结果显示，这些基因

主要参与细胞结构、分子结合及代谢过程等生物学功能。类黄酮是豆科植物与根瘤菌开始信号交流的第一步，共

鉴定出紫云英中类黄酮合成通路的关键酶基因41个；R基因在豆科植物与根瘤菌互作中发挥重要作用，鉴定出R

基因中最主要的一类NBS基因成员64个。将紫云英unigenes与plantTFDB数据库比对，鉴定出MYB、AP2/ERF、

WRKY和bHLH等转录因子367个。通过MISA分析13047条长度大于1000bp的unigenes，鉴定出4187个SSR

位点，并设计相应引物。【结论】通过转录组测序分析鉴定‘粤绿肥1号’紫云英的根瘤菌互作和转录因子等基因，

并设计SSR引物，可为深入探索紫云英资源鉴定和遗传改良提供数据支持。

关键词：紫云英；转录组；unigene；功能注释；SSR；根瘤菌；转录因子

中图分类号：S32文献标志码：A文章编号：1004-874X（2025）03-0035-08

TranscriptomeSequencingandBioinformaticAnalysis

ofAstragalussinicus‘YuelvfeiNo.1’