系统生物学课件(完整版).pptVIP

系统生物学;定义

(Definition);WhatisSystemsBiology?;WhatisSystemsBiology?;近几十年来发展最为迅速的生物科学;分子生物学与系统生物学;

侧重从实验中获取数据;背景学科;系统生物学方法;;TheCompleteProteomicsSolution;BMCSystemsBiology

生命的化学进化

主导地位：分析、分解、还原

NakanishiS.

In2000,Hoodco-founded,andiscurrentlyPresidentof,theInstituteforSystemsBiologyinSeattlewhichpioneerssystemsapproachestobiologyandmedicine.

MALDI可离子化蛋白而又不破坏蛋白。

Analysisofdifference

SBW平台

从基因到细胞、到组织、到个体的各个层次的整合。

孙之荣等译，科学出版社，。

SonyComputerScienceLaboratories

)ComputationalSystemsBiology,ElsevierAcademicPress,2006.

生命活动三要素：物质、能量、信息

UniversityofGotenberg,Sweden

生命起源的学说

Tounderstandbiologyatthesystemlevel,wemustexaminethestructureanddynamicsofcellularandorganismalfunction,ratherthanthecharacteristicsofisolatedpartsofacellororganism.

“HolismandEvolution”

信息技术（DryPart）;质谱技术;Understandingofsystemstructure

面向过程与面向对象的程序设计

SystemsBiology:ATextbook,Wiley-VCH,

基因表达的调控

研究思路和方法的整合。

BioSPIProjectatWeizmann,Israel

)ComputationalSystemsBiology,ElsevierAcademicPress,2006.

Science,295,1662-1664(2002).

杂交和印迹技术

Automatedspotdigestion

DIGE与常规的双向电泳技术比较，更加简单、劳动强度更低、效率更高。

实验技术（WetPart）

从基因到细胞、到组织、到个体的各个层次的整合。

第二步：系统地改变被研究对象的内部组成成分（如基因突变）或外部生长条件，然后观测在这些情况下系统组分或结构所发生的相应变化，包括基因表达、蛋白质表达和相互作用、代谢途径等的变化，并把得到的有关信息进行整合。

系统生物学的目标就是要得到一个理想的模型，使其理论预测能够反映出生物系统的真实性。;;;;系统生物学与相关学科的关系;系统生物学与合成生物学的关系;传统分子生物学;;还原论及其局限性;“系统论是还原论和整体论的辩证统一”

-----钱学森;是生物学

是数据整合

是建模仿真

是系统科学;第一步：对选定的某一生物系统的所有组分进行了解和确定，描绘出该系统的结构，包括基因相互作用网络和代谢途径，以及细胞内和细胞间的作用机理，以此构造出一个初步的系统模型。

第二步：系统地改变被研究对象的内部组成成分（如基因突变）或外部生长条件，然后观测在这些情况下系统组分或结构所发生的相应变化，包括基因表达、蛋白质表达和相互作用、代谢途径等的变化，并把得到的有关信息进行整合。

第三步：把通过实验得到的数据与根据模型预测的情况进行比较，并对初始模型进行修订。

第四步：是根据修正后的模型的预测或假设，设定和实施新的改变系统状态的实验，重复第二步和第三步，不断地通过实验数据对模型进行修订和精练。系统生物学的目标就是要得到一个理想的模型，使其理论预测能够反映出生物系统的真实性。;FourAspects;;自上而下(Top-down，以Hood为代表)

自下而上(Bottom-up，以Kitano为代表)

整合(Integration)

扰动法(Perturbation);整合－系统生物学的核心;

生命科学

信息科学

系统科学;生物学

物理学

化学

工程学

数学

计算科学;实验技术（WetPart）

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