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分子植物育种,2025年,第23卷,第5期,第1436-1442页
MolecularPlantBreeinVo1.23,No.5,1436-1442
研究报告
ResearchReport
谷子已糖激酶基因家族鉴定及表达分析
王思佳*引
张米欢*胡东坡张德春**
三峡大学生物技术研究中心,宜昌,443002
*同等贡献作者
**通信作者,zhangdechun@
摘要为了明确谷子(Setariaitalica)已糖激酶(hexokinase,HXK)家族成员特征,以谷子HXK基因家族成
员为研究对象,对其结构特征、表达模式、系统进化及预测蛋白理化性质等进行了分析。结果显示:通过同源
分析,在谷子蛋白数据库中鉴定出6个HXK家族成员,分布在3号和5号染色体上;系统进化分析表明谷
子HXK基因家族可分为2个分支,分别是CladeI和CladeIⅡI;基因结构分析显示,HXK基因家族成员外显
子数目变异较小,除SiHXK3外所有成员均含有9个外显子;启动子分析结果表明,6个SiHXK基因启动子
顺式作用元件种类和数量存在差异,表明各基因家族成员可能具有不同的功能;组织表达模式分析表明,
SiHXK基因在谷子根、茎、叶、幼苗和种子中具有不同的表达特性,其中,SiHXK1在幼苗中的表达量高,
SiHXK2在叶片中的表达量较高,SiHXK3、SiHXK4和SiHXK6在种子中的表达量较高,暗示SiHXK基因家
族不同成员可能在谷子发育不同时期发挥作用。本研究为今后研究谷子HXK的功能提供了参考。
关键词谷子;基因家族;HXK;表达模式
IdentificationandExpressionAnalysisofSetariaitalicaHexokinaseGene
Family
WangSijia*ZhangMihuan*HuDongpoZhangDechun
BiotechnologyResearchCenter,ThreeGorgesUniversity,Yichang,443002
*Theseauthorscontributeequallytothiswork
**Correspondingauthor,zhangdechun@
DOI:10.13271/j.mpb.023.001436
AbstractInordertoclarifythecharacteristicsofthemembersoftheSetariaitalicahexokinase(HXK)family,
takingthemembersoftheSetariaitalicaHXKgenefamilyastheresearchobject,thestructuralcharacteristics,ex-
pressionpatterns,phylogeneticevolutionandpredictedproteinphysicalandchemicalpropertieswereanalyzed.
Theresultsshowedthatthroughhomologyanalysis,sixHXKfamilymemberswereidentifiedintheSetariaitalica
proteindatabase,whicharedistributedonchromosomes3andchromosomes5.Phylogeneticanalysisshowedthat
theSetariaitalicaHXKgenefamilycanbedividedintotwobranches,namelyCladeIandCladeII;genestructure
analysisshowsthatthenumberofexonsofHXKgenefamilymembershasasmallvariation,allmembersexcept
SiHXK3contain9exons;theresultsofpromoteranalysisindicatethatthetypesandquantitiesofcis-actingele-
mentsinthepromotersofthesixS
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