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分子植物育种,2025年,第23卷,第4期,第1278-1284页
MolecularPlantBiVONo.4,1278-1284
研究报告
ResearchReport
莲类合成酶(TPS)基因家族鉴定与分析
秦莉莉1杨宁宁1张晨!唐佳伟邓开宇2张克轩2董臣
1河南工业大学生物工程学院,郑州,450001;2河南工业大学国际教育学院,郑州,450001
*通信作者,chen.dong@
摘要类化合物是植物界中数量最多的天然代谢物,具有多种重要的生物学功能,类合成酶
(terpenoidsynthase,TPS)在类物质合成中起着关键作用。莲(Nelumbonucifera)是中国重要的药食两用的植
物,关于其类物质及TPS基因家族的研究相对较少,本研究利用生物信息学技术鉴定莲的TPS基因家族,
并分析了其基因结构、保守结构域、理化性质、蛋白质结构、基因表达特性等。结果表明,莲的TPS家族共有
8个成员,分别命名为NnTPS01~NnTPS08。NnTPSs分为4个亚族,分布在3条染色体上,且均含有1个
TPS和1个TPP结构域。理化性质分析表明,莲的TPS家族成员编码的蛋白均为酸性亲水蛋白。二级结构预
测显示莲TPS基因家族编码的蛋白均以α-螺旋和无规卷曲为主。有6个蛋白亚细胞定位于叶绿体。顺式作
用元件分析发现NnTPSs含有多种生物与非生物胁迫的作用元件。基因表达特性分析显示有7个基因可以
表达,有5个基因在叶中表达量出现了上调,并且发现大多数基因在茎中都不表达。本研究结果为后续研究
莲TPS基因家族功能特性提供科学依据。
关键词莲;类化合物;TPS基因家族;生物信息学;基因表达
IdentificationandAnalysisofTPSGeneFamilyinNelumbonucifera
QinLili1YangNingningiZhangChen1TangJiawei2DengKaiyu?ZhangKexuan?DongChenI*
1CollegeofBiologicalEngineering,HenanUniversityofTechnology,Zhengzhou,450001;2CollegeofInternationalEducation,HenanUniversityof
Technology,Zhengzhou,450001
*Correspondingauthor,chen.dong@
DOI:10.13271/j.mpb.023.001278
AbstractTerpenoidsarethemostabundantnaturalmetabolitesintheplantkingdomandhaveavarietyof
importantbiologicalfunctions.Terpenoidsynthase(TPS)playsakeyroleinthesynthesisofterpenoids.Nelumbo
nuciferaisanimportantmedicinalandedibleplantinChina.Therearerelativelyfewstudiesonitsterpenoidsand
TPSgenefamily.Inthisstudy,bioinformaticstechnologyusedtoidentifytheTPSgenefamilyinNelumbonucifera,
andanalyzeditsgenestructures,conserveddomains,physicalandchemicalproperties,proteinstructure,andexpres-
sionprofiles,etc.TheresultsshowedthatTPSgenefamilyhas8membersinN.nucifera,namedasNnTPSO1~
NnTPS08.NnTPSsaredividedintofoursub-families,andtheyaredistributedonthreechromosomes,andeach
contains1TPSand1TPPdomain.The
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