冬瓜NAC基因家族的全基因组鉴定及BhNAC63的功能初探.pdfVIP

冬瓜NAC基因家族的全基因组鉴定及BhNAC63的功能初探.pdf

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摘要

摘要

冬瓜(Benincasahispida)是葫芦科重要的蔬菜作物之一,广泛分布于亚洲

的热带、亚热带及温带地区,在中国主要分布于华南、华东和西南地区,栽培

面积广,具有重要的经济价值和营养价值。NAC(NAM、ATAF和CUC)基因家

族是植物中最大的基因家族之一,在植物生长发育、激素信号转导和响应非生

物胁迫过程中发挥重要作用。目前,对冬瓜NAC基因家族及成员的的功能还知

之甚少。本研究基于已发布的冬瓜参考基因组,对冬瓜NAC基因家族进行全基

因组鉴定和生物信息学分析;根据系统发育分析,选取AtNAC3亚组中的冬瓜

BhNAC63基因为研究对象,分析其在不同组织、果实不同发育时期以及激素处

理和非生物胁迫下的表达模式,通过亚细胞定位、转录活性验证和遗传转化拟

南芥,初步解析BhNAC63在果实发育及胁迫响应中的功能。本研究主要结果如

下:

1、冬瓜NAC基因家族的全基因组鉴定和生物信息学分析

从冬瓜基因组中共鉴定到74个BhNACs基因,根据它们在冬瓜基因组中的

物理位置,将其命名为BhNAC1至BhNAC74。BhNACs基因ORF的长度范围是

705~1071bp,编码的氨基酸数量范围是234~354aa。根据系统发育分析分为Ⅰ

和Ⅱ两个亚家族,包含25个亚组(C1-C25)。C15(ATAF)亚组、C16(AtNAC3)

亚组、C17(NAP)亚组和C25(NAM)亚组中包含许多典型的应激应答NAC

基因。基因结构分析表明,同一亚组内的BhNAC基因具有相似的外显子/内含子

结构和蛋白基序。

2、BhNAC63基因的表达模式分析

通过同源基因功能,选取AtNAC3亚组的BhNAC63基因作为研究对象。利

用qRT-PCR技术研究其在不同组织、不同果实发育时期以及在盐、干旱、高温、

I

摘要

低温等非生物胁迫下的表达模式。结果表明,BhNAC63基因具有明显的组织表

达特异性,在花和果实中高表达,暗示该基因在植物生长发育中具有潜在的生

物学功能。启动子顺式作用元件分析表明,BhNAC63基因含有响应非生物胁迫

和激素的元件。qRT-PCR结果证实,NaCl、低温、干旱等非生物胁迫以及JA、

ABA、SA等激素处理均可上调BhNAC63的表达。推断BhNAC63在植物对非生

物胁迫的响应中发挥重要作用,并参与了冬瓜的激素信号转导。

3、BhNAC63基因的功能分析

亚细胞定位分析表明,BhNAC63蛋白定位于细胞核中,符合转录因子特性;

酵母转录活性验证表明,BhNAC63蛋白具有转录激活活性。在拟南芥中异源过

表达BhNAC63,发现植株在生长发育过程中出现早花、早果、早衰,整个生育

期缩短现象。qRT-PCR结果表明过表达株系中叶片衰老标记基因SAGs,如

NAC16、NAC59、SGR1、PPH的表达水平显著高于野生型,揭示BhNAC63可能

通过直接或间接促进SAGs基因的表达,加速植物衰老,从而缩短植物生命周期。

基于以上研究结果,推测BhNAC63在冬瓜生长发育中发挥重要作用。

综上所述,本研究对冬瓜74个NAC家族基因进行鉴定和生物信息学分析,

结合表达模式分析结果筛选出一个在果实发育过程中高表达的基因(BhNAC63),

在拟南芥中异源过表达促进了植株的生长发育,结果为后续进一步解析

BhNAC63在冬瓜生长发育过程中的功能及调控机制提供了理论依据,同时为冬

瓜分子育种提供了重要参考。

关键词:冬瓜;NAC;生物信息学分析;果实发育;功能验证

II

ABSTRACT

ABSTRACT

Waxgourd(Benincasahispida)isoneoftheimportantvegetablecropsof

Cucurbitaceaefamily,widelydistributedintropica

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