2025年大学《生物信息学》专业题库—— RNA修饰生物信息学方法研究.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——RNA修饰生物信息学方法研究

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.下列哪一项不是常见的RNA修饰类型？

A.m6A

B.m5C

C.m7G

D.dm6A

E.dCTP

2.用于检测RNA上特定修饰位点的捕获和测序技术是？

A.RNA-Seq

B.Ribo-mapping

C.CLIP-seq(如HITS-CLIP,PAR-CLIP)

D.BS-Seq

E.DRIP-Seq

3.在RNA修饰测序数据分析中，通常首先需要使用哪些工具进行质量控制？

A.MACS2,StringTie

B.HISAT2,StringTie

C.fastp,Trimmomatic

D.Samtools,BedTools

E.UCSCGenomeBrowser,IGV

4.RNA修饰的定量分析中，计算修饰在特定基因或转录本上出现的频率通常使用？

A.TPM(TranscriptsPerMillion)

B.FPKM(FragmentsPerKilobaseMillion)

C.RPKM(ReadsPerKilobaseMillion)

D.MAF(MinorAlleleFrequency)

E.ReadCount

5.比较不同条件下RNA修饰水平差异，识别显著富集的区域或基因，通常使用？

A.STAR

B.HISAT2

C.MACS2

D.DESeq2

E.Bowtie2

6.以下哪项技术主要用于研究RNA与蛋白质的相互作用，从而间接推断RNA修饰位点？

A.Ribo-mapping

B.CLIP-seq

C.RNA-seq

D.BS-Seq

E.UV-crosslinking

7.RNA修饰的“表观遗传调控”主要体现在？

A.改变DNA序列

B.影响RNA的稳定性

C.修改RNA的二级结构

D.直接改变蛋白质序列

E.调节染色质结构

8.在进行RNA修饰富集分析时，常用的数据库或工具包括？

A.UniProt,GO

B.GTEx,ENCODE

C.KEGG,Reactome

D.DAVID,Metascape

E.NCBIRefSeq,Ensembl

9.RNA修饰生物信息学研究中，整合分析不同类型修饰或不同实验条件数据具有重要意义，其目的是？

A.提高数据量

B.增加计算复杂度

C.揭示修饰间的协同作用或调控网络

D.简化分析流程

E.替代单类型修饰分析

10.单细胞水平的RNA修饰测序技术主要挑战在于？

A.数据量巨大

B.修饰本底信号高

C.获取高质量单细胞RNA

D.分析工具缺乏

E.需要非常昂贵的测序平台

二、填空题（每空1分，共15分）

1.RNA上最常见的修饰是腺苷的____________修饰，其广泛参与____________、____________和____________等过程。

2.RNA修饰测序技术中，CLIP-seq通常在捕获修饰位点的后，需要添加一个____________碱基，以便区分修饰与非修饰的位点。

3.RNA修饰的数据分析流程通常包括：数据____________、____________对齐、____________定量、____________识别、____________分析和____________可视化等主要步骤。

4.比较不同样本间RNA修饰水平变化时，常用的统计检验方法有____________和____________。

5.RNA修饰可以被多种____________（如____________、____________、____________）识别和结合，进而影响RNA的生命周期和功能。

6.为了确保RNA修饰分析结果的可靠性，需要关注____________、____________和____________等因素。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述Ribo-mapping技术的基本原理及其与CLIP-seq技术的核心区别。

2.