2025年大学《生物信息学》专业题库—— 结构基因组学技术在病原体研究中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——结构基因组学技术在病原体研究中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、名词解释（每题3分，共15分）

1.结构基因组学

2.X射线晶体学

3.冷冻电镜（单颗粒）技术

4.同源重组（在结构基因组学中的应用）

5.蛋白质结构域

二、简答题（每题5分，共25分）

1.简述结构基因组学研究的典型流程。

2.与传统基因组学相比，结构基因组学在病原体研究中具有哪些优势？

3.简要说明冷冻电镜技术（特别是单颗粒分析）在结构基因组学研究中的独特优势及其面临的挑战。

4.结构基因组学数据如何帮助科学家识别和验证病原体的潜在药物靶点？

5.病原体结构基因组学研究中常用的公共数据库有哪些？并简述其中之一的主要功能。

三、论述题（每题10分，共30分）

1.详细阐述结构基因组学数据在解析病原体毒力因子功能和作用机制方面的应用实例（可任选一种病原体，如病毒、细菌或真菌）。

2.结合具体应用场景，讨论结构基因组学技术在快速鉴定未知病原体或追踪病原体变异方面的作用及其局限性。

3.论述结构基因组学与其他“组学”技术（如基因组学、转录组学、蛋白质组学）相结合，在深入理解病原体生命活动和宿主互作方面的协同效应和研究价值。

试卷答案

一、名词解释

1.结构基因组学：指通过测定生物体（通常是全基因组）中所有或大部分蛋白质的原子级结构，进而推断其基因组序列、功能元件和分子进化的综合性研究策略。它侧重于获取实验结构数据，并通过这些数据来解析基因功能和调控网络。

**解析思路：*定义核心是“通过测定蛋白质结构来推断基因组信息”，强调其与序列基因组学的区别和联系，以及其目标（解析功能、进化）。

2.X射线晶体学：利用X射线照射生物大分子晶体，通过分析衍射图谱来测定晶体中原子三维排列结构的技术。它是目前测定蛋白质等生物大分子高分辨率结构最成熟和最主要的方法之一。

**解析思路：*定义核心是“X射线照射晶体+分析衍射图谱+测定原子结构”，强调其技术原理和作为主要方法的地位。

3.冷冻电镜（单颗粒）技术：指将生物样品（如病毒、细菌、蛋白质复合物等）悬浮在液体乙烷中快速冷冻，然后在低温透射电镜下观察大量随机取向的、未结晶的单个颗粒图像，通过计算平均化来解析其三维结构的技术。特别适用于难以获得高质量晶体或研究柔性大分子组装体的结构。

**解析思路：*定义核心是“冷冻样品+低温电镜+观察单颗粒+计算平均结构”，强调其适用对象（非晶体、柔性）和与多晶X射线、单晶X射线、冷冻电镜微晶的区别。

4.同源重组（在结构基因组学中的应用）：在结构基因组学中，指利用已知的、与目标病原体基因同源的蛋白质结构信息，通过同源建模等方法预测目标蛋白质的结构。这种技术常用于为基因组中尚未解析结构的基因“拼装”或预测结构模型，尤其是在基因组序列相似性较高时。

**解析思路：*定义核心是“利用已知同源结构预测未知结构”，强调其在结构基因组学中的具体作用——模型预测，以及应用前提（序列同源性）。

5.蛋白质结构域：蛋白质分子中具有独立三级结构、功能相对独立、并能与其他分子（如其他蛋白质、DNA、RNA）特异性结合的区域。一个蛋白质可以包含一个或多个结构域。结构基因组学研究常通过识别结构域来推断蛋白质的功能和进化关系。

**解析思路：*定义核心是“蛋白质中独立三级结构+功能相对独立+可结合区域”，强调其作为蛋白质基本功能单位的特性，以及其在结构解析和功能预测中的意义。

二、简答题

1.简述结构基因组学研究的典型流程。

*答案：结构基因组学研究流程通常包括：①样品制备（表达、纯化目标蛋白质或获取细胞/病毒样品）；②结构测定（采用X射线晶体学、冷冻电镜等技术获取蛋白质或核酸的高分辨率结构数据）；③数据解析（对衍射图谱或电子显微图像进行处理，解析出原子坐标）；④结构注释与功能预测（利用结构信息进行蛋白质折叠识别、功能位点预测、同源比较、分子对接等）；⑤数据整合与发布（将结构数据及其分析结果提交至公共数据库，如PDB，并可能结合基因组学数据进行系统生物学分析）。

**解析思路：*按时间顺序或逻辑顺序列出关键步骤：从样品到数据，再到信息解读和发布，覆盖结构基因组学的主要环节。

2.与传统基因组学相比，结构基因组学在病原体研究中具有哪些优势？

*答案：结构基因组学在病原体研究中的优势主要体现在：①能够直接解析蛋白质等生物大分子的三维结构，为理解病原体的致病机制、宿主互作、药物靶点等提供直观的分子基础；②对于基