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Gly-X-ProorGly-X-Hyp第61页,共94页,星期日,2025年,2月5日第62页,共94页,星期日,2025年,2月5日蛋白质的空间结构(构象、高级结构)—蛋白质的三级结构—蛋白质分子中所有原子(包括主链和侧链)在三维空间的排列分布。第63页,共94页,星期日,2025年,2月5日共价键次级键化学键肽键一级结构氢键二硫键二、三、四级结构疏水键其它:盐键配位键范德华力三、四级结构(三)蛋白质分子中的共价键与次级键第64页,共94页,星期日,2025年,2月5日第65页,共94页,星期日,2025年,2月5日第66页,共94页,星期日,2025年,2月5日第29页,共94页,星期日,2025年,2月5日肽键和肽氨基酸通过肽键连接形成的产物称为肽(peptide)。最简单的肽是由二个氨基酸残基形成的肽,称为二肽。肽单位(peptideunit):
又称之肽基(peptidegroup),是肽链主链上的重复结构。是由参与肽键形成的氮原子和碳原子和它们的4个取代成分:羰基氧原子、酰胺氢原子和两个相邻的α-碳原子组成的一个平面单位。
氨基酸残基第30页,共94页,星期日,2025年,2月5日五肽结构式
第31页,共94页,星期日,2025年,2月5日第32页,共94页,星期日,2025年,2月5日GramicidinS,anantibioticproducedbythebacteriumBacillusbreuis.Thearrowsindicatethedirectionfromtheaminotowardthecarboxylendofeachresidue.Thepeptidehasnoterminibecauseitiscircular.Ornisthesymbolforornithine,anaminoacidthatgenerallydoesnotoccurinproteins.NotethatgramicidinScontainstworesiduesofaD-aminoacid(D-phenylalanine).第33页,共94页,星期日,2025年,2月5日第34页,共94页,星期日,2025年,2月5日第35页,共94页,星期日,2025年,2月5日第二节蛋白质的分子结构第36页,共94页,星期日,2025年,2月5日第37页,共94页,星期日,2025年,2月5日蛋白质一级结构(primarystructure):
指蛋白质中共价连接的氨基酸残基的排列顺序与二硫键的位置
Sanger于1953年完成了第一个蛋白质-胰岛素的氨基酸序列测定。蛋白质的氨基酸序列是阐明蛋白质生物活性的分子基础;
蛋白质的一级结构决定它的空间结构;
氨基酸序列的改变可以导致蛋白功能异常和疾病;
通过对一些蛋白质的氨基酸序列的比较可以反应出一些生物亲缘关系第38页,共94页,星期日,2025年,2月5日第39页,共94页,星期日,2025年,2月5日第40页,共94页,星期日,2025年,2月5日第41页,共94页,星期日,2025年,2月5日第42页,共94页,星期日,2025年,2月5日第43页,共94页,星期日,2025年,2月5日第44页,共94页,星期日,2025年,2月5日蛋白质的二级结构——指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式(1)α-螺旋(α-helix)Pauling和Corey于1965年提出。结构要点:1)螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转100°。2)每个肽键的羰基氧与远在第四个氨基酸氨基上的氢形成氢键(hydrogenbond),氢键的走向平行于螺旋轴,所有肽键都能参与链内氢键的形成。—C—(NH—C—CO)3N—OHHR3.613(ns)第45页,共94页,星期日,2025年,2月5日第46页,共94页,星期日,2025年,2月5日第47页,共94页,星期日,2025年,2月5日第48页,共94页,星期日,2025年,2月5日第49页,共94页,星期日,2025年,2月5日第50页,共94页,星期日,2025年,2月5日第51页,共94页,星期日,2025年,2月5日第52页,共94页,星期日,2025年,2月5日第53页,共94页,星期日,2025年,2月5日第54页,共94页,星期日,2025
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