甘蓝SNP指纹图谱构建.pdfVIP

中国农业科学2018,51(14):2771-2787

ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2018.14.014

甘蓝SNP标记开发及主要品种的DNA指纹图谱构建

李志远，于海龙，方智远，杨丽梅，刘玉梅，庄木，吕红豪，张扬勇

（中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081）

摘要：【目的】搜集生产上的主要甘蓝品种，构建基于SNP标记的品种指纹图谱，为鉴定甘蓝品种的特异性、

真实性提供依据。【方法】首先，利用50个甘蓝高代自交系的重测序数据，与甘蓝参考基因组（02-12）进行比对筛

选SNP位点。挑选多态性较好、在染色体上均匀分布的SNP位点，并将其转化为KASP标记，利用KASP平台对供试

材料进行检测，得到59个甘蓝品种的基因分型数据。根据基因分型数据，筛选出多态性信息含量（PIC）高、无基

因型数据缺失且在染色体上均匀分布的标记作为构建指纹图谱的核心标记。将核心标记的分型结果转化为二元