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JournalofZhengzhouUniversity(MedicalSciences)Sep.2025Vol.60No.5593
doi:10.13705/j.issn.1671 ̄6825.2024.11.066
肝细胞癌基因诊断标志物和免疫浸润标志物的分析和识别
1)1)1)2)3)
王子康ꎬ王龙飞ꎬ王克雷ꎬ方艳ꎬ刘超
1)郑州大学第二附属医院普通外科郑州4500142)郑州大学第二附属医院药学部郑州4500143)郑州大学第五附属医院
肝胆外科郑州450052
关键词肝细胞癌ꎻ机器学习ꎻ生物标志物ꎻ免疫浸润
中图分类号R730.4
摘要目的:筛选潜在的肝细胞癌(HCC)基因诊断和免疫浸润标志物ꎮ方法:下载GEO数据库和TCGA数据
库中HCC和邻近正常组织(NAT)基因表达谱微阵列数据ꎮ基于GEO数据ꎬ采用LASSO回归、随机森林模型筛选
HCC高度相关的差异表达基因(HDEG)ꎬ基于TCGA数据绘制各HDEG诊断HCC的ROC曲线ꎬ以AUC的95%CI
下限大于0.8的HDEG为潜在的诊断标志物ꎮ收集郑州大学第二附属医院16例HCC及其配对NAT组织ꎬ实时荧
光定量PCR法检测各诊断标志物的表达水平ꎮ基于GEO数据ꎬ采用单样本基因集富集分析算法评估诊断标志物
与22种免疫细胞免疫浸润的相关性ꎮ结果:载脂蛋白F(APOF)、铁调素抗菌肽(HAMP)、补体9(C9)、金属硫蛋白
1E(MT1E)被筛选为潜在的HCC基因诊断标志物ꎬAUC(95%CI)分别为0.953(0.933~0.973)、0.946(0.922~
0.970)、0.926(0.901~0.951)、0.925(0.899~0.950)ꎬ其在HCC组织中的表达均较NAT下调(P0.05)ꎮHCC
组织中γδT细胞、单核细胞、M2巨噬细胞、活化的肥大细胞和中性粒细胞浸润减少ꎬ活化的记忆CD4T细胞、调节
性T细胞和M0巨噬细胞浸润增加(P均0.05)ꎮAPOF、HAMP、C9、MT1E与多种免疫细胞和免疫功能相关(P均
0.05)ꎮ结论:APOF、HAMP、C9、MT1E可能是潜在的HCC基因诊断标志物及治疗靶点ꎮ
Analysisandidentificationofbiomarkersfordiagnosisandimmuneinfil ̄
trationofhepatocellularcarcinoma
1)1)1)2)3)
WANGZikangꎬWANGLongfeiꎬWANGKeleiꎬFANGYanꎬLIUChao
1)DepartmentofGeneralSurgeryꎬtheSecondAffiliatedHospitalꎬZhengzhouUniversityꎬZhengzhou450014
2)DepartmentofPharmacyꎬtheSecondAffiliatedHospitalꎬZhengzhouUniversityꎬZhengzhou450014
3)DepartmentofHepatobiliarySurgeryꎬtheFifthAffiliatedHospitalꎬZhengzhouUniversityꎬZhengzhou
450052
Keywordshepatocellularcarcinomaꎻmachinelearningꎻbiomarkerꎻimmuneinfiltration
AbstractAim:Toscreenthepotentialbiomarkersforgenediagnosisandimmuneinfiltrationofhepatocellularcarci ̄
noma(HCC).Methods:Geneexpressionprofilemicroarraydataofbothno
初级会计持证人
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