林木双碱基编辑器脱靶全基因组检测生信 Snakemake 流程与容器试题库及答案.docVIP

林木双碱基编辑器脱靶全基因组检测生信Snakemake流程与容器试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.Snakemake流程文件的后缀名通常是？

A..smkB..pyC..txtD..sh

2.全基因组检测中第一步常是？

A.数据比对B.变异检测C.数据清洗D.结果可视化

3.以下哪种不是生信常用容器？

A.DockerB.SingularityC.UbuntuD.Conda

4.双碱基编辑器主要编辑哪种碱基对？

A.A-TB.C-GC.A-CD.T-G

5.Snakemake中定义规则的关键字是？

A.ruleB.defC.funcD.main

6.全基因组数据一般存储格式是？

A..jpgB..fastqC..pdfD..docx

7.用于在容器中安装软件的命令，在Docker里常是？

A.installB.apt-getinstallC.yuminstallD.pacman-S

8.双碱基编辑器脱靶检测重点关注？

A.编码区B.非编码区C.启动子区D.全基因组

9.Snakemake流程可以实现？

A.单线程运行B.多线程运行C.不支持并行D.只能单机运行

10.生信容器的主要优势是？

A.增加计算速度B.方便软件部署C.降低硬件需求D.提高数据准确性

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.以下属于Snakemake特点的有？

A.可重复性B.易读性C.支持并行D.只能处理小数据

2.全基因组检测涉及的步骤有？

A.样本采集B.文库构建C.测序D.数据分析

3.常用的生信数据处理工具在容器中可安装的有？

A.BWAB.SamtoolsC.GATKD.Photoshop

4.双碱基编辑器脱靶可能带来的影响有？

A.基因功能改变B.引发疾病C.无影响D.改变物种进化方向

5.构建Snakemake流程需考虑？

A.输入输出文件B.运行规则C.软件依赖D.配色方案

6.生信容器技术的好处有？

A.环境隔离B.便于移植C.提高安全性D.降低成本

7.全基因组数据质量控制内容包括？

A.碱基质量B.测序深度C.数据完整性D.文件格式

8.双碱基编辑器应用领域有？

A.基因治疗B.作物育种C.药物研发D.建筑设计

9.Snakemake规则定义中可包含？

A.输入文件B.输出文件C.运行命令D.注释

10.选择生信容器时需考虑因素有？

A.容器大小B.软件支持情况C.与宿主系统兼容性D.美观程度

三、判断题（每题2分，共10题）

1.Snakemake流程只能在Linux系统运行。（）

2.全基因组检测不需要进行质量控制。（）

3.Docker容器比Singularity容器更安全。（）

4.双碱基编辑器不会在非目标位点编辑。（）

5.Snakemake中一个规则只能有一个输出文件。（）

6.生信容器可以完全替代本地安装软件。（）

7.全基因组检测结果可视化对分析没太大作用。（）

8.双碱基编辑器在人类基因编辑上无限制。（）

9.Snakemake不支持从远程服务器获取数据。（）

10.安装生信容器必须联网。（）

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述Snakemake流程在林木双碱基编辑器脱靶全基因组检测中的作用。

答：Snakemake可实现检测流程自动化、可重复。按规则有序处理各步骤，如数据清洗、比对、变异检测等，支持并行提高效率，确保流程可靠、易维护。

2.说明全基因组检测中生信容器的重要性。

答：生信容器能隔离软件运行环境，避免环境冲突。便于安装和管理各种生信工具，移植性强，不同系统可快速部署，保障检测流程顺利进行，提高工作效率。

3.列举双碱基编辑器脱靶全基因组检测的关键环节。

答：关键环节有样本准备，保证高质量DNA；测序获取全基因组数据；数据比对定位序列；变异检测找潜在脱靶位点；结果验证确认脱靶情况。

4.简述在Snakemake流程中如何处理软件依赖。

答：可在Snakemake规则中指定软件版本。利用容器技术，如Docker或Conda环境，将软件及其依赖打包，