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基于CRISPR的微生物菌株改造提升生物基化学品产率1

基于CRISPR的微生物菌株改造提升生物基化学品产率

摘要

本报告系统阐述了基于CRISPR技术的微生物菌株改造在提升生物基化学品产率

方面的应用前景与实施路径。随着全球对可持续发展和碳中和目标的追求，生物制造产

业正迎来前所未有的发展机遇。CRISPRCas系统作为革命性的基因编辑工具，为微生

物代谢工程提供了高效、精准的解决方案。本报告首先分析了生物基化学品市场的现状

与挑战，指出传统菌株改造方法的局限性；随后深入探讨了CRISPR技术的作用机制

及其在微生物改造中的独特优势；在此基础上，提出了系统化的技术路线和研究方法，

包括靶点筛选、编辑策略设计、高通量筛选平台构建等关键环节；详细规划了从实验室

研究到工业化应用的实施方案；并对潜在风险进行了全面评估，提出了相应的保障措

施。研究表明，通过CRISPR技术对关键代谢通路进行精准调控，可显著提高目标化

学品的产率，部分案例显示提升幅度可达35倍。本报告旨在为相关科研机构和企业提

供技术参考，推动生物制造产业的高质量发展。

引言与背景

全球生物制造产业发展趋势

生物制造产业作为绿色经济的重要组成部分，正经历着前所未有的快速增长。根据

国际能源署(IEA)2023年发布的《生物基化学品市场展望》，全球生物基化学品市场规

模预计将在2030年达到1500亿美元，年复合增长率超过12%。这一增长主要受到两

方面驱动：一是各国碳中和政策的推动，二是消费者对可持续产品偏好的增强。欧盟”

绿色协议”明确提出到2030年生物基产品替代30%化石基产品的目标；中国”十四五”

生物经济发展规划也将生物制造列为重点发展方向。在这一背景下，如何提高生物基化

学品的生产效率成为产业发展的关键瓶颈。

传统化学合成工艺依赖化石原料，存在高能耗、高污染等问题。相比之下，生物制

造利用可再生生物质资源，通过微生物发酵生产目标化学品，具有条件温和、环境友好

等优势。然而，当前大多数生物基化学品的生产效率仍难以与石油基路线竞争，主要受

限于微生物菌株的性能。因此，开发高效的菌株改造技术，提升微生物细胞工厂的生产

能力，成为推动生物制造产业发展的核心议题。

CRISPR技术革命性突破

CRISPRCas(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeatsCRISPR

associatedproteins)系统是近年来生命科学领域最具突破性的技术之一。自2012年首

次被证明可用于哺乳动物基因编辑以来，CRISPR技术迅速发展，已在基础研究、医疗

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诊断、农业育种等多个领域展现出巨大潜力。在微生物工程领域，CRISPR技术相比传

统方法具有明显优势：编辑效率高、操作简便、可多位点同时编辑、适用范围广等。

CRISPRCas9系统作为最常用的基因编辑工具，通过向导RNA(gRNA)引导

Cas9核酸酶对特定DNA序列进行切割，实现基因的敲除、插入或替换。随着技术

的不断优化，现已开发出多种变体系统，如CRISPRCas12a(识别富含T的PAM序

列)、CRISPRCas13(靶向RNA)等，进一步扩展了应用范围。特别值得注意的是，

CRISPRi/a(干扰/激活)系统可以在不改变DNA序列的情况下调控基因表达，为代谢

通路精细调控提供了新工具。这些技术进步为微生物菌株的精准改造奠定了坚实基础。

研究意义与价值

本研究的意义体现在三个层面：科学价值上，将推动对微生物代谢网络调控机制

的深入理解；技术价值上，可开发出具有自主知识产权的高效菌株改造技术平台；产业

价值上，有望显著降低生物基化学品生产成本，加速产业化进程。以乳酸为例，作为重

要的平台化合物，全球年需求量超过200万吨，若通过CRISPR改造将生产效率提高

50%，每年可减少约100万吨二氧化碳排放，经济效益和环境效益显著。

从国家战略角度看，掌握核心菌株改造技术对保障生物经济安全至关重要。当前，

高端工业菌株仍主要依赖进口，存在”卡脖子”风险。发展基于