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探秘大肠杆菌blaNDM耐药基因：多源追踪与传播解码

一、引言

1.1研究背景与意义

细菌耐药问题已成为全球公共卫生领域面临的严峻挑战之一。随着抗菌药物在医疗、畜牧养殖等领域的广泛使用，细菌耐药性不断增强，耐药基因的传播日益复杂，给临床治疗和公共卫生安全带来了巨大威胁。据《柳叶刀》杂志刊发的论文显示，2019年全球约127万人死于耐药细菌感染，英国政府2014年委托的专家小组数据表明，到2050年，细菌感染每年可能导致多达1000万人死亡。中国工程院院士钟南山也多次指出多重耐药的严峻性，强调解决细菌耐药的问题已经刻不容缓。

大肠杆菌作为一种常见的革兰氏阴性菌，广泛存在于人和动物的肠道、自然环境以及食品中。它不仅是引起人和动物肠道感染及其他部位感染的重要病原菌，还可作为耐药基因的储存库和传播载体。blaNDM耐药基因是一种能够编码新德里金属β-内酰胺酶（NewDelhimetallo-β-lactamase，NDM）的基因，该酶能够水解包括碳青霉烯类在内的几乎所有β-内酰胺类抗生素，使细菌对这些重要的抗菌药物产生耐药性。自2009年在印度新德里首次发现携带blaNDM基因的细菌以来，blaNDM耐药基因在全球范围内迅速传播，引起了广泛关注。

研究不同来源大肠杆菌中blaNDM耐药基因的流行及传播特点具有重要的公共卫生意义。在家禽养殖业中，沈建忠院士课题组发现碳青霉烯耐药基因blaNDM虽在上游种鸡场为阴性，但在商品鸡场的鸡、鸟、狗和苍蝇，甚至饲养员携带的大肠杆菌中阳性率极高，并且能传播至下游生产链条，这表明blaNDM耐药基因在家禽产业链中的传播可能对食品安全和人类健康构成潜在威胁。了解blaNDM耐药基因在不同来源大肠杆菌中的流行情况，有助于及时掌握耐药基因的分布范围和变化趋势，为制定针对性的防控措施提供依据。研究其传播特点，如传播途径、传播媒介以及在不同宿主和环境之间的传播规律，能够帮助我们切断传播链，有效遏制耐药基因的扩散，降低耐药菌感染的发生率，保障临床治疗的有效性，减少因耐药菌感染导致的医疗费用增加和死亡率上升，同时也有助于维护养殖业的健康发展，保障食品安全和公共卫生安全。

1.2国内外研究现状

在国外，关于大肠杆菌blaNDM耐药基因的研究开展较早且较为深入。早期研究主要集中在对blaNDM耐药基因的发现和鉴定上，自2009年首次发现后，陆续在多个国家和地区的临床分离株中检测到该基因。随后，研究重点逐渐转向流行情况和传播特点。有研究对欧洲、美洲、亚洲等多个地区的医院感染病例进行监测，发现blaNDM耐药基因在不同地区的流行率存在差异，且在一些地区呈现上升趋势。在传播特点方面，研究表明blaNDM耐药基因主要通过质粒介导的水平转移在细菌间传播，不同类型的质粒与blaNDM耐药基因的传播密切相关，如IncX3型质粒、IncHI2型质粒等。还发现耐药基因可通过食物链、水源等途径在动物与人之间传播，候鸟迁徙、人员流动等也可能促进其在不同地区间的扩散。

国内相关研究近年来也取得了显著进展。在流行情况方面，众多学者对不同地区的临床分离株、动物源菌株以及环境源菌株进行了检测。王峰等人对上海交通大学附属瑞金医院临床分离的碳青霉烯类耐药大肠埃希菌进行研究，发现18株耐碳青霉烯类大肠埃希菌中有6株扩增到blaDNM基因，其中4株为blaDNM-1，2株为blaDNM-4。在动物源方面，沈建忠院士课题组揭示了blaNDM和mcr-1在家禽产业链及家禽养殖环境中的传播规律，发现blaNDM基因虽在上游种鸡场为阴性，但在商品鸡场及下游生产链条中广泛传播。在传播特点研究上，国内学者也关注到质粒介导的水平传播在blaNDM耐药基因扩散中的重要作用，并对携带blaNDM基因的质粒特征、基因环境等进行了深入分析。还研究了不同来源菌株的多位点序列分型（MLST），分析菌株之间的亲缘关系和传播路径。然而，目前国内外对于不同来源大肠杆菌中blaNDM耐药基因的流行及传播特点的研究仍存在一些不足，如不同地区、不同来源的研究数据存在差异，缺乏系统性和全面性的比较分析；对于传播机制的研究还不够深入，一些潜在的传播因素尚未完全明确等。

1.3研究内容与方法

本研究旨在全面探究不同来源大肠杆菌中blaNDM耐药基因的流行及传播特点。研究内容主要包括：对人源、动物源（如家禽、家畜等）、环境源（如水源、土壤、污水等）大肠杆菌分离株进行收集和鉴定，确定不同来源大肠杆菌的种类和数量；采用琼脂稀释法测定最小抑菌浓度（MIC），分析不同来源大肠杆菌对多种抗菌药物的耐药性，包括碳青霉烯类、β-内酰胺类、氨基糖苷类等常用抗菌药物，了