基于证据和图推理的文档级关系抽取方法：以医学关系为例.pdfVIP

研究论文第51卷第1期/2025年1月/计算机工程

基于证据和图推理的文档级关系抽取方法：以医学关系为例

周雪阳1-2，傅启明1,2*，陈建平2.3.4，陈延明5，陆悠12，王蕴哲1,2

（1.苏州科技大学电子与信息工程学院，江苏苏州215009；

2.苏州科技大学江苏省建筑智慧节能重点实验室，江苏苏州215009；

3.苏州科技大学建筑与城市规划学院，江苏苏州215009；4.重庆工业大数据创新中心有限公司，重庆400707；

5.苏州大学附属第二医院神经外科，江苏苏州215004)

摘要：针对生物医学文献句式穴长、实体密集从而导致关系抽取复杂度高、难度大的问题，提出一种证据路径

增强的图推理框架(EPE-GR)。首先建立一种引人结构化偏差的图注意力机制(B-GAT)增强图推理中信息聚合

的指向性，结合提及级和实体级图建模学习全局交互特征和局部依赖信息；其次使用启发式搜索聚焦证据句子，

同时构建一种基于掩膜多头注意力（MMHA)机制的路径推理结构，强化非邻居证据句子之间的相关性并缓解细

粒度证据编码带来的复杂度剧增的问题；最后协同全局、局部和路径推理预测实体之间的语义关系。与已有方法

相比,EPE-GR在药物-突变相互作用(DMI)数据集和化学物质诱导疾病(CDR)数据集上都获得了最佳的性能，前

者在二分类和多分类任务的设定下相比次优方法准确率分别提高了5.65和5.13百分点，后者F1值提高了

2.85百分点，证明所提方法是一个有效的生物医学文档级关系抽取方法且具有较好的泛化能力。此外，通过进一

步的实验表明所提出的关系依赖建模和证据路径推理机制能够有效提升模型推理句间关系的能力。

关键词：关系抽取；图推理；路径推理；证据增强；图注意力机制；多头注意力机制。

中图分类号：TP391文献标志码：AD0I:10.19678/j.issn.1000-3428.0068877

Document-LevelRelationExtractionMethodBasedonEvidenceand

GraphInference:ACaseStudyofMedicalRelationships

ZHOUXueyang2,FUQiming*,CHENJianping3-4,CHENYanming”,LUYou*2,WANGYunzhel-?

(1.ElectronicandInformationEngineering,SuzhouUniversityofScienceandTechnology,Suzhou215009,Jiangsu,China;

2.JiangsuProvinceKeyLaboratoryofIntelligentBuildingEnergyEfficiency,

SuzhouUniversityofScienceandTechnology,Suzhou215009,Jiangsu,China;

3.ArchitectureandUrbanPlanning,SuzhouUniversityofScienceandTechnology,Suzhou215009,Jiangsu,China;

4.ChongqingIndustrialBigDataInnovationCenterCo.,Ltd.,Chongqing400707,China;

5.DepartmentofNeurosurgery,TheSecondAffiliatedHospitalofSoochowUniversity,Suzhou215004,Jiangsu,China)

[AbstractToaddressthechallenges