7株奶牛源牛支原体中国分离株的比较基因组学分析.pdfVIP

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南京农业大学学报２０２５ꎬ４８(４):８９２９０１ｈｔｔｐ://ｎａｕｘｂ.ｎｊａｕ.ｅｄｕ.ｃｎ

ＪｏｕｒｎａｌｏｆＮａｎｊｉｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＤＯＩ:１０.７６８５/ｊｎａｕ.２０２４０３０３７

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吴春琳ꎬ王梦瑶ꎬ吴雨伦ꎬ等.７株奶牛源牛支原体中国分离株的比较基因组学分析[Ｊ].南京农业大学学报ꎬ２０２５ꎬ４８(４):８９２９０１.

ＷＵＣｈｕｎｌｉｎꎬＷＡＮＧＭｅｎｇｙａｏꎬＷＵＹｕｌｕｎꎬｅｔａｌ.ＣｏｍｐａｒａｔｉｖｅｇｅｎｏｍｉｃａｎａｌｙｓｉｓｏｆＭｙｃｏｐｌａｓｍａｂｏｖｉｓｉｎＣｈｉｎｅｓｅｄａｉｒｙｃａｔｔｌｅ[Ｊ].ＪｏｕｒｎａｌｏｆＮａｎｊｉｎｇ

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ＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ２０２５ꎬ４８(４):８９２９０１.

７株奶牛源牛支原体中国分离株的比较基因组学分析

１１１１２１１∗

吴春琳ꎬ王梦瑶ꎬ吴雨伦ꎬ殳婕ꎬ孙学强ꎬ潘子豪ꎬ姚火春

(１.南京农业大学ＯＩＥ猪链球菌病参考实验室/动物医学院ꎬ江苏南京２１００９５ꎻ

２.中国青岛动物卫生与流行病学中心ꎬ山东青岛２６６０００)

摘要:[目的]本文旨在利用高通量测序技术结合生物信息学方法探究中国部分地区奶牛源牛支原体分离株的基因组多样

性和遗传相关性ꎮ[方法]通过ＰＣＲ、测序等技术对中国６个省(自治区)奶牛临床样本进行牛支原体的分离鉴定ꎮ结合从

ＮＣＢＩ数据库中获取的２８株牛支原体基因组ꎬ运用生物信息学技术对分离株进行泛基因组分析和系统发育、毒力基因及耐

药基因分析ꎮ[结果]共分离到７株牛支原体ꎬ命名为Ｐ￣ＭＢ１—Ｐ￣ＭＢ７ꎮ分离株的基因组全长范围为９２０~９７０ｋｂꎻ含有

８８２~９２７个编码基因ꎮ泛基因组分析结果显示ꎬ以上菌株的基因组中共含有２８３３个基因ꎬ核心基因数为４７４ꎬ占比１６.７％ꎮ

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核心基因组的系统进化和多位点序列分型(ＭＬＳＴ)显示ꎬ国内分离株多属于Ⅰ群ꎬＳＴ５２型ꎮ毒力基因预测表明ꎬ不同分离

株均携带７个毒力因子相关基因ꎬ涉及黏附、酶、细胞毒性等ꎮ此外ꎬ共检测到１３个耐药基因ꎬ其中头孢菌素类和艾法霉素

类耐药基因ＩｒｅＫ和ＥＦ￣Ｔｕ的携带率最高(１００％)ꎮ[结论]本研究结果进一步丰富了国内牛支原体流行株的基因组结构、

组成和进化信息ꎬ也为未来牛支原体适应性进化机制的研究提供了遗传背景资料ꎮ

关键词:牛支原体ꎻ分离鉴定ꎻ全基因组学ꎻ系统进化分群ꎻ毒力基因ꎻ耐药基因

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中图分类号:Ｓ８５２.６２文献标志码:Ａ文章编号:１０００２０３０(２０２５)０４０８９２１０

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