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846局解手术学杂志JREGANATOPERSURG2025,34(10)http://www.jjssxzz.cn
doi10.11659/jjssx.04E025099·基础研究·
:
基于机器学习和转录组学分析创伤性凝血功能障碍生物标志物
幸熙尧,佘汉,吴银雨,毛庆祥,闫红,胡弋(陆军军医大学大坪医院麻醉科,重庆400042)
[摘要]目的深入探究创伤性凝血功能障碍(TIC)的发病机制,明确其具体的致病因素和病理生理过程,以寻找有效的诊
断指标和治疗靶点。方法从基因表达综合数据库(GEO)获取创伤失血性休克患者的转录组数据,筛选差异表达基因(DEGs)。从
京都基因与基因组百科全书(KEGG)获取凝血相关基因(CRGs),并与DEGs进行交集分析。采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)
及随机森林(RF)两种机器学习算法识别关键基因。采用CIBERSORT算法分析关键基因与免疫细胞浸润的相关性。通过共识聚
类,将创伤患者进行亚型分析,以比较免疫细胞浸润情况。构建创伤失血性休克大鼠模型,验证凝血功能及关键基因的表达。
结果数据集包含17例健康对照者和478例创伤失血性休克患者的样本。在校正P0.05的筛选标准下,共鉴定出6315个DEGs。
基因集富集分析(GSEA)显示,上调的DEGs显著富集于葡萄糖代谢通路,而下调的DEGs则富集于免疫反应相关通路。通过交叉分
析DEGs与CRGs,共筛选出65个差异表达的凝血相关基因(DE-CRGs),GO功能富集显示,这些基因主要定位于分泌颗粒膜和血小
板α颗粒,并参与血液凝固、体液水平调节及伤口愈合等生理过程。KEGG通路分析显示,这些基因显著富集于血小板激活、补体和
凝血级联反应、Rap1信号通路及人巨细胞病毒感染等途径。通过机器学习鉴定出6个关键DE-CRGs,受试者工作特征(ROC)曲线分
析表明这些基因具有良好的诊断效能。CIBERSORT分析显示,关键基因与免疫细胞浸润之间存在显著相关性。基于6个关键基因
+
将患者分为两类:亚型A富含CD8T细胞与活化NK细胞,表现为免疫活跃状态;亚型B以单核细胞和静息NK细胞为主,免疫通路
激活不足。大鼠动物实验表明,失血性休克可导致凝血功能障碍,qRT-PCR结果进一步证实关键基因的表达趋势与生物信息学分析
结果一致。结论本研究通过转录组学与机器学习方法,系统性筛选出了6个与TIC密切相关的关键基因,即GNA13、PIK3R3、
ITGAM、MAPK14、PPP1CC和LYN,并揭示了其与凝血功能、免疫浸润的紧密联系。动物实验验证进一步支持了这些基因作为潜在
诊断与治疗靶点的价值。
[关键词]创伤性凝血功能障碍;凝血相关基因;转录组学分析;机器学习;免疫细胞浸润
[中图分类号]R641[文献标志码]A[收稿日期]2025-04-18
Analyzethebiomarkersoftrauma-inducedcoagulopathybasedonmachinelearningandtranscriptomics
XINGXi-yao,SHEHan,WUYin-yu,MAOQing-xiang,YANHong,HUYi(DepartmentofAnesthesiology,DapingHospital,
ArmyMedicalUniversity,Chongqing400042,China)
Abstract:ObjectiveToelucidatethemechanismsoftrauma-inducedcoagulopathy(TIC),clarifythespecificpathogenicfactorsand
pathophysiologicalprocesses,anddiscovertheeffectivediagnosticindicatorsandtherapeut
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