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第22卷第2期延安大学学报（医学科学版）Vol.22No.2

2024年6月JournalofYananUniversity(MedicalScienceEdition)Jun.2024

DOI：10.19893/j.cnki.ydyxb.2024-0024

•基础研究•

基于TCGA数据库分析参与结肠癌进展的关键基因

111，21，21，2*

杨洋，黄小勇，高宁，赵菊梅，杜娟

（1.延安大学医学院，陕西延安716000；2.延安市肿瘤发生发展与抗肿瘤药物研发科技

创新团队，陕西延安716000）

摘要：目的通过生物信息学方法与实验验证挖掘结肠癌发生发展中的关键基因，预测可用于诊断结肠癌

（colorectalcancer，CRC）的生物标志物。方法从TCGA数据库中获取结肠癌转录组数据，用edgR，Deseq2和

limma3个R包分析癌组织与癌旁组织的差异性，将得到的差异基因进行GeneOntology（GO）和KyotoEncyclopedia

ofGenesandGenomes（KEGG）分析。通过STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络后，置于Cytoscape软件中进行可

视化及核心基因筛选。利用R包对核心基因进行Kaplan-Meier单因素生存分析，通过qRT-PCR对13对结肠癌及

配对癌旁组织中各核心基因的表达进行检测。结果研究共获得1645个差异基因，其中712个上调，933个下调。

上调基因主要富集在类风湿性关节炎、IL-17信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Wnt信号通路、Hippo信

号通路。下调基因主要富集在矿物质吸收、神经活性配体-受体相互作用、CAMP信号通路、胆汁分泌、碳酸氢盐在

肾单位近曲小管重吸收等通路。研究共获得10个核心基因：CXCL8、CXCL1、CXCL12、CXCL5、CSF2、CXCL2、

CXCL3、CXCL11、CCL19和CCL13。生存分析显示CXCL8、CXCL5、CSF2、CCL13、CCL19、CXCL12与结肠癌预后相关，

qRT-PCR检测结果证实CXCL8、CXCL5和CSF2结肠癌及癌旁组织中的表达有明显差异。结论结肠癌发生发展

过程中CXCL8、CXCL5和CSF2基因存在表达变化，可能在结肠癌的发生发展中起关键作用。

关键词：结肠癌；生物信息学；转录组测序；差异表达基因

中图分类号：R735.3文献标识码：A文章编号：1672-2639（2024）02-0001-07

Screenofkeygenesinvolvedincoloncancerprogressionbasedon

TCGAdatabase

111，21，21，2*

YANGYang，HUANGXiaoyong，GAONing，ZHAOJumei，DUJuan

（1.MedicalCollegeofYananUniversity，Yanan716000，China；2.YananScientificandTechnological

InnovationTeamforTumorIncidence，Development，andAnti-TumorDr