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营养饲料·NutritionandFeedstuffs2025年第61卷第03期
蒙古牛瘤胃微生物的宏基因组学分析
11111231*
马建飞,徐均钊,胡宗福,吴白乙拉,吴江鸿,包呼格吉乐图,白德日根,牛化欣
(1.内蒙古民族大学动物科技学院,内蒙古通辽028000;2.内蒙古自治区农牧业技术推广中心,
内蒙古呼和浩特010000;3.内蒙古自治区乌拉盖管理区农牧技术推广中心,内蒙古锡林郭勒盟026321)
摘要:试验旨在系统解析地域特色的蒙古牛瘤胃微生物结构、功能及其耐粗饲生物特性。选取冬季放牧的
3~4岁、体重约460kg的蒙古牛6头,经口采集瘤胃液样品,利用Nova-seq宏基因组测序技术分析蒙古牛瘤
胃微生物群落结构及功能基因组成。结果显示:共获得525067826条有效序列,构建非冗余基因集后共获得
8022168个基因;物种注释结果表明细菌占比丰度为95.25%,其余属于古菌、真菌、纤毛虫和病毒。蒙古
牛瘤胃优势菌群依次为拟杆菌门(Bacteroidota)、厚壁菌门(Firmicutes)和广古菌门(Euryarchaeota);在
属水平上相对丰度依次为拟杆菌属(
Bacteroides)、普雷沃氏菌属(Prevotella)和梭菌属(Clostridium)等;
在碳水化合物活性酶(CAZy)水平功能分析中,蒙古牛瘤胃微生物基因主要集中在糖苷水解酶(GH)中,
其中GH2、GH3、GH31、GH51、GH97家族的基因丰度占比较高,且寡糖降解酶的基因数量最多;蒙古牛
瘤胃微生物种与CAZy关联分析显示,GH家族是纤维素降解酶的主要来源,所注释的微生物主要有普雷沃
氏菌(29.39%)、拟杆菌(26.69%)、梭菌(7.65%)和颤螺菌(2.21%)等;在KEGG分析中,碳水化合
物代谢和氨基酸代谢通路的丰度最高。可见,蒙古牛瘤胃富含纤维素降解菌、相关酶类功能基因及代谢通路。
关键词:瘤胃微生物;宏基因组;功能;纤维素降解酶;蒙古牛
中图分类号S823.5文献标识码ADOI编号10.19556/j.0258-703302
:::
蒙古牛是我国北方草原区域特色的优良黄牛遗传品是含量种类最多的酶梭状芽孢杆菌属普雷沃氏菌属
、,、、
种资源养殖以草原放牧为主具有耐粗饲耐寒和抗拟杆菌属纤维杆菌属和瘤胃球菌属是瘤胃CAZy的主
,,、、
病力强等特性[1],可将难以利用的高纤维植物有效转化要贡献者随着宏基因组测序技术发展利用这种技术
。,
为优质肉奶这种高效转化得益于瘤胃微生物对植物能够更精确更全面地研究瘤胃微生物结构及功能[11],
、,、
纤维素的降解作用[2-3]。瘤胃微生物可以分泌各种各样然而采用此技术解析蒙古牛瘤胃微生物区系的研究尚未
的碳水化合物活性酶CAZy[4],用来降解饲料中的见报道因此本研究基于此技术探究冬季放牧采食天
()。,
纤维素等复杂多糖[5-6]。诸多研究采用宏基因组技术分然干牧草条件下蒙古牛瘤胃微生物组成功能注释旨
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