MSTN^(-_-)牛肌肉miRNA测序及生物信息学分析.pdfVIP

黑龙江牧兽医2024（14）:49-55,124-125畜牧科学

D0I:10.13881/ki.hljxmsy.2023.05.0010

MSTN-/-牛肌肉miRNA测序及

生物信息学分析

STD

王桥梦，强明威，陈星宇，胡德宝，张林林，李新，丁向彬，郭宏*，郭益文

（天津农学院天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室，天津300384）

中图分类号：S823.2文献标识码：A文章编号：1004-7034(2024)14-0049-09

摘要：为了探寻参与调控动物骨骼肌生长发育的肌肉生长抑制素（myostatin，MSTN）基因的相关miRNA，试验活

体采集了5头MSTN基因敲除（MSTN--）鲁西黄牛（试验组）和5头野生型鲁西黄牛（对照组）的腿臀肌肉，提取肌

肉总RNA进行miRNA测序，筛选两组鲁西黄牛肌肉样品间差异表达的miRNA，分析miRNA序列的碱基偏好性，并

预测显著差异表达miRNA的靶基因，然后对靶基因进行GO功能和KEGG信号通路富集分析，最后利用实时荧光

定量PCR在MSTN基因干扰牛骨骼肌卫星细胞模型上验证miRNA测序数据的准确性。结果表明：miRNA序列第

一位碱基的偏好性因长度不同而不同，且不同位置碱基具有偏好性；试验组和对照组样品共鉴定到761个差异表达

miRNA，其中有12个显著差异表达miRNA

miR-410、miR-335、miR-2447、miR-147、miR-33a、miR-654），其中试验组有9个较对照组高表达的miRNA（miR-

22851、miR-12006、miR-6533、miR-450b、miR-410、miR-335、miR-147、miR-33a、miR-654）和3个低表达miRNA

（miR-496、miR-6524、miR-2447）；预测到5969个显著差异表达miRNA的靶基因和9280个靶位点；靶基因主要

富集在细胞内部、膜结合细胞器、蛋白结合、生物过程的正向调节等相关功能和卡波氏肉瘤病毒感染、胞吞作用、

MAPK信号通路等代谢通路；验证试验中的6个miRNA

miR-496)的表达量变化均与测序结果的变化趋势一致。说明12个显著差异表达miRNA可能参与了MSTN基因

调控牛骨骼肌生长发育过程。

关键词：肌肉生长抑制素（MSTN）；牛；差异表达miRNA；靶基因；定量分析

miRNAofMSTN-/-bovinemuscle

WANGQiaomeng,QIANGMingwei,CHENXingyu,HUDebao,ZHANGLinlin,

LIXin,DINGXiangbin,GUOHong*,GUOYiwen

（Tia

anjinKeyLaboratoryofAgriculturalAnimalBreedingandHealthyHusbandry,TianjinAg