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国家高性能计算中心（合肥）**2.高性能计算学科(17)软件集成算法和软件的整合：当今一个典型的计算机研究和应用人员必须使用不同的软件、程序库、数据库和各种来源的数据分析系统。由于工具的不兼容性妨碍了算法和软件的整合，致使研究人员用来集成不同应用软件花费的时间超过他们自行开发的软件时间。集成软件需要各学科专家团队：任何人都不可能熟练地掌握所有必须的计算机和应用领域知识(包括收集数据、建立模型、设计算法、实现和运行算法、分析和可视化计算结果等)，为此必须有一个跨学科的、各有专长的、技能互补的合作团队共同把不同部分整合到一个完整的应用软件系统中去。2.4软件(4)第30页，共57页，星期日，2025年，2月5日国家高性能计算中心（合肥）**2.高性能计算学科(18)传统的科学与工程计算科学工程计算的共性：在过去20年，计算物理是应用的主要驱动力，这类应用具有如下共同特点：应用程序常常由定义在R3×t子空间的一组PDE所描述。多物理模拟的不同物理区域的计算方法各不相同。很多应用均主要集中在大学和研究所。研究侧重点离散化PDE及其相应的线性/非线性方程的求解。强调并行机的速度和问题求解精度。很少关心相关的I/O操作。并行化方法与编程模型并行化方法：最常使用区域分解法。编程模型：最常使用数据并行。应用实例计算流体力学(CFD)计算化学(CC)环境科学与能源：水表面模拟，水质量建模，石油和天然气开采，海洋模拟和地震模拟等等。2.5应用（1）第31页，共57页，星期日，2025年，2月5日国家高性能计算中心（合肥）**2.高性能计算学科(19)与社会相关的新兴应用新应用的共性：最近几年，与社会相关的应用急剧增加与传统的计算应用分享市场空间，其共性是：应用问题常常由图来定义，而不是离散的R3空间。计算过程中的交互常是全局性的，而不是通过边界来交换信息的。新出现的应用，无相应的使用经验和成熟的软件。很多应用常集中在与社会相关的国计民生方面。研究侧重点建立诚信机制：包括硬件、软件、人机界面、安全协议的使用等。巨量的数据，而不是科学计算，将是此类应用的主要处理对象，I/O是最为关心的。数据的安全、属主、管理等带来一系列技术、法律和人道等问题。应用实例社会安全，交通管理军事应用商业：市场营销，风险投资，股票市场数字图书馆、数据挖掘、Web服务、远程医疗等。2.5应用（2）第32页，共57页，星期日，2025年，2月5日国家高性能计算中心（合肥）**2.高性能计算学科(20)并行应用的若干使能技术网格的产生问题计算求解过程：将物理区域及其边界面离散化为一组点；将点连成网格；给出格点控制方程并计算求解。网格产生过程：将物理空间映射为计算空间；为所有实体表面定义精确数值描述；沿着表面产生合适的网格。网格产生方法：迪卡尔网格法、结构网格法、非结构网格法和通用网格法。网格的映射：为了计算网格映射到一组处理器，可以使用图的剖分技术。网格生成软件：ADMeshversion0.95......方程求解器稠密线性代数算法：LU分解、块算法等。稠密线性代数库：EISPACK、LINPACK、LAPACK、SCALAPACK等。稀疏线性系统：直接与迭代解法。稀疏特征值问题：单向量法、OR算法、子空间投射法等。可重用软件与算法软件和算法的编目分类：方便查找。软件和算法封装成可重用形式：设计模式、函数与库、组件和对象等。可重用主要方法：定义模板、开发MPI通信子和中性数据结构、标准库和组件等。2.5应用(3)第33页，共57页，星期日，2025年，2月5日国家高性能计算中心（合肥）**2.高性能计算学科(21)数据密集型应用及其管理科学发现的新机会科学仪器设备的进步：科学设备精度与分辨率的提高；传感性之类的采集源爆炸式增长，产生了前所未有的大量数据，其存储量估计以每年30﹪的速率增长，为21世纪的重大科学突破提供了历史性的机会。爆炸式增长的海量数据：像天体物理，每晚将产生超过40T(T=1012)字节的数据；高能物理每年将产生数十P(P≈1015)级字节数据；高分辨率捕获人脑数据很容易超过几十P个字节，社会科学也还在经历同样数据爆炸。挖掘数据资料：计算机科学家在演示软件的可行性时，搜索两个天文数据库中数百万天体资料时发现了褐矮星，这是天天文界的惊人的精确发现!数据的管理建立数据仓库：面对着爆炸式增长的海量数据，为了使其能够符合各界需要，实现共享，国家应该建立国家级的数据仓库，鼓励和资助研究人员把他们的数据和专业软件存入这样的数据仓库，以及提供给遵守任何必须的、约定的安全或保密要求的供应