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2025年科研可视化技术案例试题及答案

2025年科研可视化技术案例试题

案例背景

2025年，某神经科学实验室开展“动态脑网络与阿尔茨海默病早期预警”研究，团队通过多模态采集技术获取了120名受试者的脑影像数据（包括结构磁共振sMRI、功能磁共振fMRI、扩散张量成像DTI）、基因表达谱（RNA-seq）及临床行为学量表（MMSE、MoCA）。数据特点如下：

-多模态异构性：结构连接（DTI纤维束追踪）为空间网络（节点为脑区，边为纤维束密度），功能连接（fMRI时间序列皮尔逊相关）为动态加权网络（时间分辨率0.72秒，共200个时间点），基因表达为高维矩阵（23,000个基因×120样本），临床量表为时序评分（每月1次，共24个月）。

-动态演化性：功能连接网络随任务（静息、记忆、情绪）切换呈现拓扑重配置，结构连接随病程（健康→轻度认知障碍MCI→AD）发生渐进性退化。

-临床关联性：需关联基因表达异常（如APOEε4突变）与脑网络异常节点（如默认模式网络DMN），并映射到临床量表的早期下降趋势（MMSE＜26）。

现有可视化工具存在以下痛点：

1.多模态数据割裂展示（如结构网络用3D脑图谱，功能网络用热图，基因数据用火山图），难以直观发现跨模态关联；

2.动态网络的时间维度仅通过动画播放呈现，关键拓扑事件（如模块拆分、核心节点转移）易被忽略；

3.临床-影像-基因的三元关联需人工比对，效率低且易遗漏弱相关模式。

试题内容

问题1：针对该研究的多模态异构数据，设计一套可视化方案，要求同时呈现结构连接、功能连接、基因表达及临床量表的关联关系，并说明各模态数据的视觉编码策略、视图布局逻辑及交互设计。（30分）

问题2：动态功能连接网络的时间演化是研究重点，需可视化其拓扑特征（如模块度、节点中心性、边权重）的时序变化，并突出关键时间点（如任务切换时刻、拓扑重配置事件）。请设计动态可视化方法，说明如何平衡全局趋势与局部细节，以及如何通过交互辅助用户识别异常演化模式。（25分）

问题3：为评估该可视化系统的有效性，需设计量化与质性相结合的评估方案。请列出具体评估指标（至少5项），并说明每项指标的测量方法及对研究目标的支撑作用。（25分）

问题4：2025年，生成式AI与可视化技术深度融合。假设实验室已部署基于大语言模型（LLM）和多模态扩散模型的AI辅助可视化工具，请提出3种AI在该研究可视化中的具体应用场景，并说明技术实现逻辑（如模型输入、输出及优化目标）。（20分）

答案解析

问题1答案

可视化方案设计：采用“核心视图+辅助视图”的多视图协同架构，核心视图为“脑网络-基因-临床”三元关联主视图，辅助视图包括动态功能网络时序轴、结构网络3D交互脑图。

1.视觉编码策略

-结构连接网络（DTI）：以3D脑图谱为基底，节点为AAL3.0脑区（共120个），节点大小编码纤维束密度（z-score标准化后映射到5-20px半径）；边为曲线连接，颜色编码纤维束类型（投射纤维→红色，联合纤维→蓝色，连合纤维→绿色），边透明度编码密度值（0.2-0.8）。

-功能连接网络（fMRI）：在3D脑图谱上方叠加2D投影层，采用力导向布局（节点位置与结构网络对齐），边权重编码为动态宽度（0.5-5px），颜色采用HSL空间（色相编码相关系数正负，明度编码绝对值大小）；时间维度通过底部时间轴滑动条控制，当前时间点标记为高亮竖线。

-基因表达数据：在3D脑图谱右侧嵌入热图矩阵（行=基因，列=样本），基因按功能聚类（如神经退行性相关基因→红色簇，抗炎基因→蓝色簇），颜色编码FPKM值（Z-score标准化后，冷色→低表达，暖色→高表达）；关键基因（如APOE）单独标注并与脑区节点建立链接（点击基因名，对应高表达脑区节点闪烁）。

-临床量表：在热图下方配置折线图（x=时间，y=MMSE/MoCA评分），每个样本对应一条曲线，颜色与样本在热图中的列颜色一致（保持样本身份追踪）；评分阈值（MMSE=26）用水平虚线标注，曲线低于阈值部分填充红色阴影。

2.视图布局逻辑

主视图采用“3D脑图谱（占屏40%）+基因热图（占屏30%）+临床折线图（占屏20%）+时间轴（占屏10%）”的横向排列，确保空间连续性；3D脑图谱可通过鼠标拖拽旋转，缩放时自动调整节点标签可见性（缩放比＜0.8时隐藏标签，≥0.8时显示缩写）。

3.交互设计

-跨视图联动：点击3D脑区节点，基因热图自动筛选该脑区高表达基因（通过预计算的脑区-基因共表达矩阵），临床折线图高亮该样本的评分曲线；反之，选择热图中的基因簇，3D脑图谱中对应高关联脑区节点加粗，功能连