水稻特大粒材料lg1和lg2粒形基因的功能变异位点分析.pdfVIP

江西农业大学学报2025，47（1）http://xuebao.jxau.

ActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensis/10.3724/aauj.2025001

汪欲鹏，杜一帆，陈慧珍，等.水稻特大粒材料lg1和lg2粒形基因的功能变异位点分析［J］.江西农业大学学报，2025，47

（1）：1-9.

WANGYP,DUYF,CHENHZ,etal.Analysisoffunctionalvariationlocusofgrainshaperelatedgenesinricebiggraingerm‑

plasmlg1andlg2[J].ActaagriculturaeuniversitatisJiangxiensis,2025,47(1):1-9.

水稻特大粒材料lg1和lg2粒形基因的

功能变异位点分析

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汪欲鹏，杜一帆，陈慧珍，王智权，李昕雨，邓梓阳，吴自明

（1.江西农业大学农学院/教育部作物生理生态与遗传育种实验室，江西南昌330045；2.江西省萍乡市农业科学研

究中心，江西萍乡337099；3.江西省农业科学院水稻研究所，江西南昌330200）

摘要：【目的】水稻的粒长、粒宽和千粒质量是重要的品质与产量性状，特殊粒形材料的研究可为水稻品种粒

形的遗传改良提供重要的基因资源。【方法】以常规粳稻品种日本晴和籼稻品种黄华占为参考，对2个水稻特

大粒材料lg1和lg2基因组中9个粒形主效基因（qGL3、GS3、qLGY3、GS9、GW2、GW5、GW8、TGW3、TGW6）的功能变

异位点进行了分析。【结果】与日本晴相比，lg1和lg2中粒长基因GS3和粒宽基因GW2分别在编码区第165位和

第382位发生单碱基替换，其中突变分别导致了GS3翻译提前终止和GW2功能减弱，而GW8在5非翻译区存

在10bp的插入，导致其功能减弱；此外，lg2中qLGY3发生了31bp的缺失，导致其编码区发生了移码，其他粒

形基因没有检测到功能发生明显变化的变异。与黄华占相比，在lg1和lg2中除检测到GW2和qLGY3的功能

变异位点外，还在2个材料的GW5编码区上游检测到了950bp的片段缺失。【结论】lg1基因组聚合了GS3、

GW2、GW5、GW8的功能缺失或减弱的变异位点，lg2基因组中聚合了GS3、GW2、GW5、GW8、qLGY3的功能缺失

或减弱的变异位点，研究结果为粒形基因的遗传互作及特大粒材料lg1和lg2粒形形成的机制解析提供依据。

关键词：水稻；粒形；千粒质量；大粒材料；粒形基因；遗传变异

中图分类号：S511.032文献标志码：A开放科学（资源服务）标识码（OSID）：

文章编号：1000-2286（2025）01-0001-09

Analysisoffunctionalvariationlocusofgrainshaperelatedgenes

inricebiggraingermplasmlg1andlg2

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WANGYupeng，DUYifan，CHENHuizhen，WANGZhiquan，